MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2973566820 · doi:10.1177/2324709619877050

Severe Combined Dyslipidemia With a Complex Genetic Basis

2019· article· en· W2973566820 sur OpenAlexafffund
Ryan T. Le, Minan Abbas, Adam D. McIntyre, Robert A. Hegele

Notice bibliographique

RevueJournal of Investigative Medicine High Impact Case Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLipoproteins and Cardiovascular Health
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésMedicineInternal medicineEzetimibeDyslipidemiaApolipoprotein EEndocrinologyMissense mutationCompound heterozygosityFamilial hypercholesterolemiaFenofibrateGastroenterologyAlleleCholesterolGeneticsDiseaseBiologyMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. Familial dysbetalipoproteinemia (also known as type 3 hyperlipoproteinemia) is typically associated with homozygosity for the apolipoprotein E2 isoform, but also sometimes with dominant rare missense variants in the APOE gene. Patients present with roughly equimolar elevations of cholesterol and triglyceride (TG) due to pathologic accumulation of remnant lipoprotein particles. Clinical features include tuberoeruptive xanthomas, palmar xanthomas, and premature vascular disease. Case. A 48-year-old male presented with severe combined dyslipidemia: total cholesterol and TG were 11.5 and 21.4 mmol/L, respectively. He had dyslipidemia since his early 20s, with tuberous xanthomas on his elbows and knees. His body mass index was 42 kg/m 2 . He also had treated hypertension, mild renal impairment, and a history of gout. He had no history of cardiovascular disease, peripheral arterial disease, or pancreatitis. Multiple medications had been advised including rosuvastatin, ezetimibe, fenofibrate, and alirocumab, but his lipid levels were never adequately controlled. Genetic Analysis. Targeted next-generation sequencing identified (1) the APOE E2/E2 homozygous genotype classically described with familial dysbetalipoproteinemia; (2) in addition, one APOE E2 allele contained the rare heterozygous missense variant p.G145D, previously termed apo E-Bethesda; (3) a rare heterozygous APOC2 nonsense variant p.Q92X; and (4) a high polygenic risk score for TG levels (16 out of 28 TG-raising alleles) at the 82nd percentile for age and sex. Conclusion. The multiple genetic “hits” on top of the classical APOE E2/E2 genotype likely explain the more severe dyslipidemia and refractory clinical phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,048
Score d'incertitude au seuil0,996

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Investigative Medicine High Impact Case ReportsMême sujetLipoproteins and Cardiovascular HealthTravaux en français237 207