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Enregistrement W2973696871 · doi:10.15406/jmen.2019.07.00245

Spectrophotometric determination of biofilm formation by Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis in aqueous extract of schmutzdecke for clarifying untreated water in water treatment operations

2019· article· en· W2973696871 sur OpenAlexfundno aff
George Aboagye, MT Rowe

Notice bibliographique

RevueJournal of Microbiology & Experimentation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMycobacterium research and diagnosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgri-Food and Biosciences InstituteQueen's UniversityQueen's University Belfast
Mots-clésParatuberculosisBiofilmMicrobiologyMycobacterium avium subsp. paratuberculosisAqueous solutionMycobacteriumMycobacterium avium complexChemistryWater treatmentEnvironmental chemistryBiologyBacteriaEnvironmental scienceEnvironmental engineeringOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium avium ssp.paratuberculosis (Map) causes Johne's disease in ruminants, and implicated in the aetiology of human Crohn's disease.The survival of Map in the environment and its ability to multiply inside a host has been reported, however, unknown by which mechanism.Biofilm formation by some species of mycobacteria is noted as a means of survival and host adaptation, with such knowledge lacking for Map.In this work, biofilm formation by 3 isolates of Map, 2 from the environment and 1 from a Crohn's disease patient, was determined using spectrophotometric analysis.Since Map is fastidious and persists in water with or without nutrients, aqueous extract of schmutzdecke was employed to ascertain the impact of a complex microcosm of nutritional composition on biofilm formation by a fastidious slow growing Mycobacterium.Since cells must adhere onto a suitable surface in order to initiate biofilm formation, adherence assay was carried out firstly on 2 surfaces i.e. aluminium and stainless steel plates on which all the 3 Map isolates adhered, but greatly on the aluminium compared to the stainless steel.Secondly, biofilm formation by the isolates was determined on polyvinyl chloride (PVC) plates, and all were positive for biofilm formation.The extent of biofilm formation as influenced by distilled water (DW, control) alongside aqueous extracts of filtered and unfiltered schmutzdecke (FAES and UAES) was also determined statistically at P<0.05.The order of significance was 0.0004, 0.0307 and 0.0487 for DW, FAES and UAES respectively.This study showed that Map could form biofilm under conditions that its immediate environment provides, and could serve as a mechanism for its survival and thrive in the environment and host.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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