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Enregistrement W2973758064 · doi:10.1101/773507

Gravity-based microfiltration reveals unexpected prevalence of circulating tumor cell clusters in ovarian and colorectal cancer

2019· preprint· en· W2973758064 sur OpenAlexafffund
Anne Meunier, Javier Alejandro Hernández-Castro, Nicholas Chahley, Laudine Communal, Sara Kheireddine, Newsha Koushki, Nadia Davoudvandi, Sara Al Habyan, Benjamin Péant, Anthoula Lazaris, Andy Ng, Teodor Veres, Luke McCaffrey, Diane Provencher, Peter Metrakos, Anne‐Marie Mes‐Masson, David Juncker

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill University Health CentreNational Research Council CanadaCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMcGill UniversityMcGill University and Génome Québec Innovation Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaInstitute of Cancer ResearchInstitut Du Cancer de MontréalUniversité de MontréalCalifornia HIV/AIDS Research Program
Mots-clésCirculating tumor cellColorectal cancerOvarian cancerMetastasisCancer researchDiseaseMedicineCancerInternal medicineOncology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Circulating tumor cells (CTCs) are rare (few cells per milliliter of blood) and mostly isolated as single cell CTCs (scCTCs). CTC clusters (cCTCs), even rarer, are of growing interest, notably because of their higher metastatic potential, but very difficult to isolate. Here, we introduce gravity-based microfiltration (GµF) for facile isolation of cCTCs while minimizing unwanted cluster disaggregation, with ∼85% capture efficiency. GµF from orthotopic ovarian cancer mouse models, from 17 epithelial ovarian cancer (EOC) with either localized or metastatic disease, and from 13 metastatic colorectal cancer liver metastasis (CRCLM) patients uncovered cCTCs in every case, with between 2-100+ cells. cCTCs represented between 5-30% of all CTC capture events, and 10-80% of CTCs were clustered; remarkably, in 10 patients, most CTCs were circulating not as scCTCs, but as cCTCs. GµF uncovered the unexpected prevalence and frequency of cCTCs including sometimes very large ones in EOC patients, and motivates additional studies to uncover their properties and role in disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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