A Na+ leak channel cloned from Trichoplax adhaerens extends extracellular pH and Ca2+ sensing for the DEG/ENaC family close to the base of Metazoa
Notice bibliographique
Résumé
Acid-sensitive ion channels belonging to the degenerin/epithelial sodium channel (DEG/ENaC) family activate in response to extracellular protons and are considered unique to deuterostomes. However, sensitivity to pH/protons is more widespread, where, for example, human ENaC Na + leak channels are potentiated and mouse BASIC and Caenorhabditis elegans ACD-1 Na + leak channels are blocked by extracellular protons. For many DEG/ENaC channels, extracellular Ca 2+ ions modulate gating, and in some cases, the binding of protons and Ca 2+ is interdependent. Here, we functionally characterize a DEG/ENaC channel from the early-diverging animal Trichoplax adhaerens , Tad NaC6, that conducts Na + -selective leak currents in vitro sensitive to blockade by both extracellular protons and Ca 2+ . We determine that proton block is enhanced in low external Ca 2+ concentration, whereas calcium block is enhanced in low external proton concentration, indicative of competitive binding of these two ligands to extracellular sites of the channel protein. Tad NaC6 lacks most determinant residues for proton and Ca 2+ sensitivity in other DEG/ENaC channels, and a mutation of one conserved residue (S353A) associated with Ca 2+ block in rodent BASIC channels instead affected proton sensitivity, all indicative of independent evolution of H + and Ca 2+ sensitivity. Strikingly, Tad NaC6 was potently activated by the general DEG/ENaC channel blocker amiloride, a rare feature only reported for the acid-activated channel ASIC3. The sequence and structural divergence of Tad NaC6, coupled with its noncanonical functional features, provide unique opportunities for probing the proton, Ca 2+ , and amiloride regulation of DEG/ENaC channels and insight into the possible core-gating features of ancestral ion channels.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».