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Enregistrement W2974363127 · doi:10.1523/jneurosci.0506-19.2019

RIMB-1/RIM-Binding Protein and UNC-10/RIM Redundantly Regulate Presynaptic Localization of the Voltage-Gated Calcium Channel in<i>Caenorhabditis elegans</i>

2019· article· en· W2974363127 sur OpenAlexfundno aff
Yuto Kushibiki, Toshiharu Suzuki, Yishi Jin, Hidenori Taru

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesJapan Society for the Promotion of ScienceNational Institutes of HealthUniversity of British ColumbiaNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of Toronto
Mots-clésCaenorhabditis elegansBiologyCell biologyVoltage-dependent calcium channelSignal transducing adaptor proteinNeurotransmissionSynapseActive zoneCalcium-binding proteinCalcium channelSynaptic vesicleNeuroscienceGeneGeneticsCalciumSignal transductionChemistryReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Presynaptic active zones (AZs) contain many molecules essential for neurotransmitter release and are assembled in a highly organized manner. A network of adaptor proteins known as cytomatrix at the AZ (CAZ) is important for shaping the structural characteristics of AZ. Rab3-interacting molecule (RIM)-binding protein (RBP) family are binding partners of the CAZ protein RIM and also bind the voltage-gated calcium channels (VGCCs) in mice and flies. Here, we investigated the physiological roles of RIMB-1, the homolog of RBPs in the nematodeCaenorhabditis elegans. RIMB-1 is expressed broadly in neurons and predominantly localized at presynaptic sites. Loss-of-function animals ofrimb-1displayed slight defects in motility and response to pharmacological inhibition of synaptic transmission, suggesting a modest involvement ofrimb-1in synapse function. We analyzed genetic interactions ofrimb-1by testing candidate genes and by an unbiased forward genetic screen forrimb-1enhancer. Both analyses identified the RIM homolog UNC-10 that acts together with RIMB-1 to regulate presynaptic localization of the P/Q-type VGCC UNC-2/Cav2. We also find that the precise localization of RIMB-1 to presynaptic sites requires presynaptic UNC-2/Cav2. RIMB-1 has multiple FN3 and SH3 domains. Our transgenic rescue analysis with RIMB-1 deletion constructs revealed a functional requirement of a C-terminal SH3 in regulating UNC-2/Cav2 localization. Together, these findings suggest a redundant role of RIMB-1/RBP and UNC-10/RIM to regulate the abundance of UNC-2/Cav2 at the presynaptic AZ inC. elegans, depending on the bidirectional interplay between CAZ adaptor and channel proteins. SIGNIFICANCE STATEMENTPresynaptic active zones (AZs) are highly organized structures for synaptic transmission with characteristic networks of adaptor proteins called cytomatrix at the AZ (CAZ). In this study, we characterized a CAZ protein RIMB-1, named for RIM-binding protein (RBP), in the nematodeCaenorhabditis elegans. Through systematic analyses of genetic interactions and an unbiased genetic enhancer screen ofrimb-1, we revealed a redundant role of two CAZ proteins RIMB-1/RBP and UNC-10/RIM in regulating presynaptic localization of UNC-2/Cav2, a voltage-gated calcium channel (VGCC) critical for proper neurotransmitter release. Additionally, the precise localization of RIMB-1/RBP requires presynaptic UNC-2/Cav2. These findings provide new mechanistic insight about how the interplay among multiple CAZ adaptor proteins and VGCC contributes to the organization of presynaptic AZ.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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