Pro‐inflammatory immune cell gene expression during the third trimester of pregnancy is associated with shorter gestational length and lower birthweight
Notice bibliographique
Résumé
PROBLEM: Altered maternal immune function predicts risk for shorter gestation and low birthweight. Few studies examine associations between prenatal immune cell gene expression and gestational length or birthweight. No studies examine which cell types drive associations. The purpose of this study is to explore associations between peripheral blood immune cell gene expression and gestational length and birthweight, using transcript origin analysis. METHOD OF STUDY: Eighty-nine women were drawn from the Community Child Health Network cohort. Third trimester maternal dried blood spots were used for genome-wide transcriptional (mRNA) profiling. Gestational length and birthweight were obtained from medical charts. Covariates were age, race/ethnicity, pre-pregnancy body mass index, smoking, gestational age at blood sampling, and pregnancy infections. Associations between gene expression profiles and gestational length and birthweight were tested using general linear models. The Transcription Element Listening System (TELiS) bioinformatics analysis quantified upstream transcription factor activity. Transcript origin analysis identified leukocyte subsets mediating observed effects. RESULTS: Shorter gestation was predicted by increased NF-kB (TFBM ratio = -0.582 ± 0.172, P < .001) and monocyte activity (diagnosticity score = 0.172 ± 0.054, P < .001). Longer gestation was associated with increased dendritic cell activity (diagnosticity score = 0.194 ± 0.039, P < .001). Increased AP-1 activity predicted lower birthweight (TFBM ratio = -0.240 ± 0.111, P = .031). Dendritic cells and CD4+ and CD8+ T cells predicted birthweight-related gene expression differences (diagnosticity score P's < 0.021). CONCLUSION: Higher third trimester pro-inflammatory gene expression predicted shorter gestation and lower birthweight. Variations in monocyte and dendritic cell biology contributed to both effects, and T-cell biology contributed to higher birthweight. These analyses clarify the role of myeloid/lymphoid lineage immune regulation in pregnancy outcomes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».