Invariant chain regulates endosomal fusion and maturation through the SNARE Vti1b
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Invariant chain (Ii) is an important multifunctional player in the regulation of adaptive immune responses and is responsible for several cellular functions related to MHCI and MHCII antigen loading and antigen presentation. While regulating endosomal trafficking of MHCII and other proteins that bind to Ii, this molecule is able to influence the endosomal pathway delaying the maturation of endosomes to the late endosomal loading compartments. When expressed in cells Ii is found to increase endosomal size, but the mechanisms for this is not known. We used RNAi silencing to identify SNARE proteins controlling Ii induced increase of endosomal size and delay of the endosomal pathway. Ii was found to interact with the SNARE protein Vti1b. Vti1b localized at the contact sites of fusing Ii positive endosomes and a tailless Ii was able to relocate Vti1b to the plasma membrane. Furthermore, silencing Vti1b, abrogated the delay in endosomal maturation induced by Ii expression. In conclusion, Ii interacts with Vti1b and this interaction is fundamental for Ii-mediated alteration of the endosomal pathway. We propose that Ii, by interacting with SNAREs, in particular Vti1B in the biosynthetic pathway of antigen presenting cells, is able to assemble SNARE directed fusion partners in the early part of the endosomal pathway that lead to a slower endosomal maturation for efficient antigen processing and antigen loading.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».