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Enregistrement W2975036869 · doi:10.1021/acs.langmuir.9b01622

Adsorption of DNA Oligonucleotides by Boronic Acid-Functionalized Hydrogel Nanoparticles

2019· article· en· W2975036869 sur OpenAlexafffund
Yuqing Li, Zijie Zhang, Biwu Liu, Juewen Liu

Notice bibliographique

RevueLangmuir · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBoronic acidChemistryCovalent bondOligonucleotideAdsorptionDNASelf-healing hydrogelsHydrogen bondCombinatorial chemistryAptamerHydrophobic effectOrganic chemistryMoleculePolymer chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Boronic acid-functionalized hydrogels were commonly used for covalent binding of cis -diol-contained molecules such as glucose, but noncovalent adsorption by boronic acids was less studied. DNA as an important polymer has been used to enhance the function of hydrogels including boronic acid-containing gels. In this work, noncovalent interactions between DNA oligonucleotides and boronic acid-containing hydrogel nanoparticles were studied in detail. The gels were composed of either poly( N -isopropylacrylamide) or with additional 5.6 mol % of 3-acrylamidophenylboronic acid (AAPBA). DNA adsorption on the AAPBA-containing gels was achieved with a high salt concentration, which can be explained by electrostatic repulsion between DNA and boronic acid. The critical role of boronic acid was confirmed by adding competing cis -diol-containing molecules such as glucose, fructose, and cytidine. Hydrogen bonding and hydrophobic interactions are important for DNA adsorption based on inhibited adsorption by urea and dimethyl sulfoxide. Polycytosine DNA showed a higher adsorption capacity compared to the other three types of DNA homopolymers. When T 15 and T 14 -rU were compared, no covalent binding was detected for T 14 -rU, suggesting that a single terminal diol was insufficient to support covalent binding at the low concentration of DNA used. Finally, the boronic acid-containing gels were able to adsorb an aptamer and inhibit its binding function. Binding was rescued by adding glucose to block the boronic acids. This study demonstrates noncovalent boronic acid interactions with DNA, and this information could be useful for designing and optimization of related biosensors and materials.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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