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Enregistrement W2976628638 · doi:10.1139/cjm-2019-0081

Gas seepage pockmark microbiomes suggest the presence of sedimentary coal seams in the Öxarfjörður graben of northeastern Iceland

2019· article· en· W2976628638 sur OpenAlexvenueno aff
Guðný Vala Þorsteinsdóttir, Anett Blischke, Margrét Auður Sigurbjörnsdóttir, Finnbogi Óskarsson, Thórarinn S. Arnarson, Kristinn P. Magnússon, Oddur Vilhelmsson

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFirmicutesProteobacteriaGeologyDeltaproteobacteriaActinobacteriaSiliciclasticGeochemistryEnvironmental chemistryGammaproteobacteriaPaleontologyChemistry16S ribosomal RNASedimentary depositional environmentBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Natural gas seepage pockmarks are found off- and onshore in the Öxarfjörður graben, Iceland. The bacterial communities of two onshore seepage sites were analysed by 16S rRNA gene amplicon sequencing; the geochemical characteristics, hydrocarbon content, and the carbon isotope composition of the sites were also determined. While one site was found to be characterised by biogenic origin of methane gas, with a carbon isotope ratio (δ 13 C (‰)) of −63.2, high contents of organic matter and complex hydrocarbons, the other site showed a mixed origin of the methane gas (δ 13 C (‰) = −26.6) with geothermal characteristics and lower organic matter content. While both sites harboured Proteobacteria as the most abundant bacterial phyla, the Deltaproteobacteria were more abundant at the geothermal site and the Alphaproteobacteria at the biogenic site. The Dehalococcoidia class of phylum Chloroflexi was abundant at the geothermal site while the Anaerolineae class was more abundant at the biogenic site. Bacterial strains from the seepage pockmarks were isolated on a variety of selective media targeting bacteria with bioremediation potential. A total of 106 strains were isolated and characterised, including representatives from the phyla Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, and Actinobacteria. This article describes the first microbial study on gas seepage pockmarks in Iceland.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,035

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,182
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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