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Genome-wide association study identifies 32 novel breast cancer susceptibility loci from overall and subtype-specific analyses
Haoyu Zhang, Thomas U. Ahearn, Julie Lecarpentier, Daniel R. Barnes, Jonathan Beesley, Xia Jiang, Tracy A. O’Mara, Guanghao Qi, Ni Zhao, Manjeet K. Bolla, Alison M. Dunning, Joe Dennis, Qin Wang, Zumuruda Abu Ful, Kristiina Aittomäki, Irene L. Andrulis, Hoda Anton‐Culver, Volker Arndt, Kristan J. Aronson, Banu Arun, Paul L. Auer, Jacopo Azzollini, Daniel Barrowdale, Heiko Becher, Matthias W. Beckmann, Sabine Behrens, Javier Benı́tez, Marina Bermisheva, Katarzyna Białkowska, Ana Blanco, Carl Blomqvist, Natalia Bogdanova, Stig E. Bojesen, Bernardo Bonanni, Davide Bondavalli, Åke Borg, Hiltrud Brauch, Hermann Brenner, Ignacio Briceño, Annegien Broeks, Sara Y. Brucker, Thomas Brüning, Barbara Burwinkel, Saundra S. Buys, Helen Byers, Trinidad Caldés, Maria A. Caligo, Mariarosaria Calvello, Daniele Campa, Jose E. Castelao, Jenny Chang‐Claude, Stephen J. Chanock, Melissa Christiaens, Hans Christiansen, Wendy K. Chung, Kathleen Claes, Christine L. Clarke, Sten Cornelissen, Fergus J. Couch, Angela Cox, Simon S. Cross, Kamila Czene, Mary B. Daly, Peter Devilee, Orland Dı́ez, Susan M. Domchek, Thilo Dörk, Miriam Dwek, Arif B. Ekici, D. Gareth Evans, Peter A. Fasching, Jonine D. Figueroa, Lenka Foretová, Florentia Fostira, Eitan Friedman, Debra Frost, Manuela Gago-Domínguez, Susan M. Gapstur, Judy E. Garber, José Á. García-Sáenz, Mia M. Gaudet, Simon A. Gayther, Graham G. Giles, Andrew K. Godwin, Mark S. Goldberg, David E. Goldgar, Anna González‐Neira, Mark H. Greene, Jacek Gronwald, Pascal Guénel, Lothar Häberle, Christopher A. Haiman, Christopher R. Hake, Per Hall, Ute Hamann, Elaine F. Harkness, Bernadette A. M. Heemskerk‐Gerritsen, Peter Hillemanns, Frans B.L. Hogervorst, Bernd Holleczek, Antoinette Hollestelle, Maartje J. Hooning, Robert N. Hoover, John L. Hopper, Anthony Howell, Hanna Huebner, Peter J. Hulick, Evgeny N. Imyanitov, Claudine Isaacs, Louise Izatt, Agnes Jager, Milena Jakimovska, Anna Jakubowska, Paul A. James, Ramunas Janavicius, Wolfgang Janni, Esther M. John, Michael E. Jones, Audrey Jung, Rudolf Kaaks, Beth Y. Karlan, Renske Keeman, Sofia Khan, Э. К. Хуснутдинова, Cari M. Kitahara, Yon-Dschun Ko, Irene Konstantopoulou, Linetta B. Koppert, Stella Koutros, Vessela N. Kristensen, Anne‐Vibeke Lænkholm, Diether Lambrechts, Susanna C. Larsson, Pierre Laurent‐Puig, Conxi Lázaro, Flavio Lejbkowicz, Goska Leslie, Fabienne Lesueur, Annika Lindblom, Jolanta Lissowska, Wing‐Yee Lo, Jennifer T. Loud, Jan Lubiński, Alicja Łukomska, Robert J. MacInnis, Mehdi Manoochehri, Siranoush Manoukian, Sara Margolin, Maria Elena Martinez, Laura Matricardi, Lesley McGuffog, Catriona McLean, Noura Mebirouk, Usha Menon, Austin Miller, Elvira Mingazheva, Marco Montagna, Anna Marie Mulligan, Claire Mulot, Taru Muranen, Katherine L. Nathanson, Susan L. Neuhausen, Heli Nevanlinna, Patrick Neven, William G. Newman, Finn Cilius Nielsen, Liene Ņikitina-Zaķe, Jesse Nodora, Kenneth Offit, Edith Olah, Olufunmilayo I. Olopade, Håkan Olsson, Nick Orr, Laura Papi, J. Papp, Tjoung‐Won Park‐Simon, Michael T. Parsons, Bernard Peissel, Ana Peixoto, Beth N. Peshkin, Paolo Peterlongo, Julian Peto, Kelly‐Anne Phillips, Marion Piedmonte, Dijana Plaseska‐Karanfilska, Karolina Prajzendanc, Ross L. Prentice, Darya Prokofyeva, Brigitte Rack, Paolo Radice, Susan J. Ramus, Johanna Rantala, Muhammad Usman Rashid, Gad Rennert, Hedy S. Rennert, Harvey A. Risch, Atocha Romero, Matti A. Rookus, Matthias Rübner, Thomas Rüdiger, Emmanouil Saloustros, Sarah Sampson, Dale P. Sandler, Elinor J. Sawyer, Maren T. Scheuner, Rita K. Schmutzler, Andreas Schneeweiß, Minouk J. Schoemaker, Ben Schöttker, Peter Schürmann, Leigha Senter, Priyanka Sharma, Mark E. Sherman, Xiao‐Ou Shu, Christian F. Singer, Snezhana Smichkoska, Penny Soucy, Melissa C. Southey, John J. Spinelli, Jennifer Stone, Dominique Stoppa‐Lyonnet, Anthony J. Swerdlow, Csilla I. Szabo, Rulla M. Tamimi, William Tapper, Jack A. Taylor, Manuel R. Teixeira, Mary Beth Terry, Mads Thomassen, Darcy L. Thull, Marc Tischkowitz, Amanda E. Toland, Rob A.�E.�M. Tollenaar, Ian Tomlinson, Diana Torres, Melissa A. Troester, Thérèse Truong, Nadine Tung, Michael Untch, Celine M. Vachon, Ans M.W. van den Ouweland, Lizet E. van der Kolk, Elke M. van Veen, Elizabeth J. van Rensburg, Ana Vega, Barbara Wappenschmidt, Clarice R. Weinberg, Jeffrey N. Weitzel, Hans Wildiers, Robert Winqvist, Alicja Wolk, Xiaohong R. Yang, Drakoulis Yannoukakos, Wei Zheng, Kristin K. Zorn, Monica Zuradelli, Roger L. Milne, Peter Kraft, Jacques Simard, Paul D.P. Pharoah, Kyriaki Michailidou, Antonis C. Antoniou, Marjanka K. Schmidt, Georgia Chenevix‐Trench, Douglas F. Easton, Nilanjan Chatterjee, Montserrat García‐Closas
Notice bibliographique
RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaCentre hospitalier universitaire de QuébecUniversity of TorontoUniversity Health NetworkInstitute of Cancer ResearchUniversité LavalInnovation Cluster (Canada)McGill UniversityQueen's UniversityLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesCancer Research UK
Mots-clésGenome-wide association studyBreast cancerBiologyEstrogen receptorHeritabilityGenetic associationGeneticsIn silicoGenetic predispositionCancerOncologyInternal medicineCancer researchSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypeMedicine
Résumé
OpenAlex consigne un résumé pour ce travail, mais il n'a pas pu être récupéré à l'instant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,408
Score d'incertitude au seuil1,000
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations45
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui