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Enregistrement W2976816195 · doi:10.1002/cpt.2166

PharmVar GeneFocus: <i>CYP2B6</i>

2021· review· en· W2976816195 sur OpenAlexafffund
Zeruesenay Desta, Ahmed El‐Boraie, Li Gong, Andrew A. Somogyi, Volker M. Lauschke, Collet Dandara, Kathrin Klein, Neil Miller, Teri E. Klein, Rachel F. Tyndale, Michelle Whirl‐Carrillo, Andrea Gaedigk

Notice bibliographique

RevueClinical Pharmacology & Therapeutics · 2021
Typereview
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteMedical Research CouncilNational Institutes of HealthCanada Research ChairsRobert Bosch StiftungHorizon 2020 Framework ProgrammeEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsNational Research FoundationCanadian Institutes of Health ResearchAustralian Centre for HIV and Hepatitis Virology ResearchEuropean CommissionVetenskapsrådetCentre for Addiction and Mental HealthMcGill University
Mots-clésMedicinePharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Pharmacogene Variation Consortium (PharmVar) catalogs star (*) allele nomenclature for the polymorphic human CYP2B6 gene. Genetic variation within the CYP2B6 gene locus impacts the metabolism or bioactivation of clinically important drugs. Of particular importance are efficacy and safety concerns regarding: efavirenz, which is used for the treatment of HIV type-1 infection; methadone, a mainstay in the treatment of opioid use disorder and as an analgesic; ketamine, used as an antidepressant and analgesic; and bupropion, which is prescribed to treat depression and for smoking cessation. This GeneFocus provides a comprehensive overview and summary of CYP2B6 and describes how haplotype information catalogued by PharmVar is utilized by the Pharmacogenomics Knowledgebase (PharmGKB) and the Clinical Pharmacogenetics Implementation Consortium (CPIC).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,060
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0060,011
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0600,043

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,569
Tête enseignante GPT0,634
Écart entre enseignants0,065 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations239
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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