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Enregistrement W2977163536 · doi:10.1371/journal.pone.0222472

Assessment modelling approaches for stocks with spawning components, seasonal and spatial dynamics, and limited resources for data collection

2019· article· en· W2977163536 sur OpenAlexafffund
Elisabeth Van Beveren, Daniel E. Duplisea, Pablo Brosset, Martín Castonguay

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish Ecology and Management Studies
Établissements canadiensFisheries and Oceans Canada
Organismes subventionnairesNational Marine Fisheries ServiceFisheries and Oceans CanadaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Oceanic and Atmospheric Administration
Mots-clésStock assessmentPopulationPopulation modelStock (firearms)Fish stockComponent (thermodynamics)Spatial ecologyData collectionFisheryEconometricsGeographyEcologyComputer scienceStatisticsBiologyFish <Actinopterygii>Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The true spatiotemporal structure of a fish population is often more complex than represented in assessments because movement between spawning components is disregarded and data at the necessary scale are unavailable. This can generate poor advice. We explore the impacts of modelling choices and their associated risks given limited data and lack of biological knowledge on spawning component structure and connectivity. Pseudo-data for an age structured fish population were simulated with two spawning components that experience various levels of connectivity and that might overlap during a certain period but segregate during reproduction. A variety of implicit spatiotemporal and simpler models were fitted to the pseudo-datasets, mimicking different situations of data availability. To reproduce the true stock characteristics, the spatiotemporal models required total catch data disaggregated by spawning component; however, catch-at-age was not as important nor were disaggregated biomass indices to reproduce true dynamics. Even with just 5% connectivity between spawning components, both the spatiotemporal models and simpler alternatives generally overestimated stock biomass. Although bias was smallest when considering one unit population, spawning components might still need to be considered for management and conservation. In such case, the spatiotemporal model was less influenced by ignored connectivity patterns compared to a model focussing on one spawning component only.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,013
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,036
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,067

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0130,036
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,138 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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