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Enregistrement W2977247797 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.757.5

Differential activation of rat and human pregnane X receptor by terpene trilactones

2010· article· en· W2977247797 sur OpenAlexafffund
Aik Jiang Lau, Thomas K. H. Chang

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésPregnane X receptorGinkgolidesChemistryTerpenePharmacologyStereochemistryBiologyBiochemistryNuclear receptorTranscription factorGeneGinkgo biloba

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pregnane X receptor regulates the expression of genes (e.g. CYP3A ) involved in various biological functions. Among the terpene trilactones, ginkgolide A induces CYP3A in rat and human hepatocytes, but conflicting data exist for bilobalide. We compared the effect of five individual terpene trilactones on rat PXR (rPXR) and human PXR (hPXR) activity. As assessed by a luciferase reporter gene assay in rPXR‐ or hPXR‐transfected human hepatoma cells (HepG2), control analysis showed that pregnenolone 16α‐carbonitrile activated rPXR with an EC 50 of 1.0 ± 0.2 μM (mean ± S.E.M., n = 4) and E max of 17 ± 2 fold, whereas rifampicin activated hPXR with an EC 50 of 0.4 ± 0.1 μM and E max of 12 ± 2 fold. Ginkgolide A (30–100 μM) activated rPXR (7–8 fold; E max = 9 ± 1 fold) to a lesser extent than hPXR (9–11 fold; E max = 12 ± 1 fold), and the EC 50 values were 12 ± 1 and 16 ± 1 μM for rPXR and hPXR activation, respectively. The increase in rPXR activity (2–8 fold) by ginkgolide B (3–100 μM) was less than that of hPXR (3–15 fold). Ginkgolide C (60–100 μM) activated rPXR to a somewhat lesser extent than hPXR, but ginkgolide J and bilobalide had no effect. In summary, several of the ginkgolides activated rPXR and hPXR differentially. Ginkgolide A and ginkgolide B were stronger activators than ginkgolide C, ginkgolide J, and bilobalide, suggesting a relationship between the structure of terpene trilactones and activation of rPXR and hPXR. [Supported by CIHR and MSFHR]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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