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Enregistrement W2977253031 · doi:10.1101/789461

β-cell dedifferentiation is associated with epithelial-mesenchymal transition triggered by miR-7-mediated repression of mSwi/Snf complex

2019· preprint· en· W2977253031 sur OpenAlexaff
Tracy C S Mak, Yorrick von Ohlen, Yi Fang Wang, Eva Kane, Kaste Jurgaityte, Pedro Ervilha, Pauline Chabosseau, Walter Distaso, Victoria Salem, Alejandra Tomás, Markus Stoffel, Piero Marchetti, A. M. James Shapiro, Guy A. Rutter, Mathieu Latreille

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésChromatin remodelingCell biologyMesenchymal stem cellPsychological repressionReprogrammingEpigeneticsEpithelial–mesenchymal transitionChromatinPDX1BiologyCancer researchTransdifferentiationmicroRNATranscription factorCellStem cellDownregulation and upregulationGene expressionGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract β-cell dedifferentiation has been revealed as a pathological mechanism underlying pancreatic dysfunction in diabetes. However, little is known on the genetic and epigenetic changes linked with the dedifferentiation of β-cells. We now report that β-cell dedifferentiation is associated with epithelial to mesenchymal transition (EMT) triggered by miR-7-mediated repression of Smarca4/Brg1 expression, a catalytic subunit of the mSwi/Snf chromatin remodeling complexes essential for β-cell transcription factors (β-TFs) activity. miR-7-mediated repression of Brg1 expression in diabetes causes an overall compaction of chromatin structure preventing β-TFs from accessing and transactivating genes maintaining the functional and epithelial identity of β-cells. Concomitantly, loss of β-cell identity impairs the ability of β-TFs Pdx1, Nkx6-1, Neurod1 to repress non-β-cell genes enriched selectively in mesenchymal cells leading to EMT, change in islet microenvironment, and fibrosis. Remarkably, anti-EMT agents normalized glucose tolerance of diabetic mice, thus revealing mesenchymal reprogramming of β-cells as a novel therapeutic target in diabetes. This study sheds light on the genetic signature of dedifferentiated β-cells and highlights how loss of mSwi/Snf activity in diabetes initiating a step-wise remodeling of epigenetic landscapes of β-cells leading to the induction of an EMT process reminiscent of a response to tissue injury.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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