Ovarian cancer and the evolution of subtype classifications using transcriptional profiling†
Notice bibliographique
Résumé
Ovarian cancer is a complex disease with multiple subtypes, each having distinct histopathologies and variable responses to treatment. This review highlights the technological milestones and the studies that have applied them to change our definitions of ovarian cancer. Over the past 50 years, technologies such as microarrays and next-generation sequencing have led to the discovery of molecular alterations that define each of the ovarian cancer subtypes and has enabled further subclassification of the most common subtype, high-grade serous ovarian cancer (HGSOC). Improvements in mutational profiling have provided valuable insight, such as the ubiquity of TP53 mutations in HGSOC tumors. However, the information derived from these technological advances has also revealed the immense heterogeneity of this disease, from variation between patients to compositional differences within single masses. In looking forward, the emerging technologies for single-cell and spatially resolved transcriptomics will allow us to better understand the cellular composition and structure of tumors and how these contribute to the molecular subtypes. Attempts to incorporate the complexities ovarian cancer has resulted in increasing sophistication of model systems, and the increased precision in molecular profiling of ovarian cancers has already led to the introduction of inhibitors of poly (ADP-ribose) polymerases as a new class of treatments for ovarian cancer with DNA repair deficiencies. Future endeavors to define increasingly accurate classification strategies for ovarian cancer subtypes will allow for confident prediction of disease progression and provide important insight into potentially targetable molecular mechanisms specific to each subtype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».