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Enregistrement W2977725993 · doi:10.14309/00000434-201410002-01704

Small Bowel Location, Stricturing Behavior, Vitamin D Receptor Polymorphism, and Metabolic Disease Susceptibility Genes Are Associated With NAFLD in Crohn’s Disease

2014· article· en· W2977725993 sur OpenAlexaboutno aff
Sultan Chhina, Kenneth Steadman, Gati Goel, Ken Nguyen, Stephan R. Targan, Xiaoxiao Li, Talin Haritunians, Dalin Li, Shaohong Yang, Dermot McGovern

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineInternal medicineGastroenterologyPopulationInflammatory bowel diseaseFatty liverMetabolic syndromeSerologyDiseaseObesityImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The relationship between metabolic syndromes and IBD is complex; there are shared susceptibility genes; abnormal fat deposition in CD with pro-inflammatory effects; and a reported NAFLD prevalence of 8% in IBD compared to 30% of the ‘healthy’ U.S. population. Our aim was to investigate the prevalence of NAFLD in a tertiary referral center and investigate clinical, serologic, and genetic associations with NAFLD in IBD patients. Methods: Patients included in our IBD repository with abdominal imaging were eligible for inclusion. Charts, CT, and U.S. reports were reviewed to determine NAFLD status. Demographic, and clinical (Montreal classification, BMI), characteristics were obtained by chart review. Serology data (ASCA, OMPc, CBir1, anti-I2 & ANCA) were generated. Genotyping was performed by Illumina technology including genome-wide and immunochip platforms. Standard statistical tests were used to test for association with appropriate correction for population structure. Results: In 1,304 IBD cases (71% CD, 29% UC/IBDU) we observed an NAFLD prevalence of 9.7%. The Prevalence of NAFLD in CD and UC was similar. NAFLD IBD patients had increased BMI (p<2.2E-16). Table 1 shows CD phenotypic associations with NAFLD. NAFLD was not associated with disease extent in UC. There were no significant associations with NAFLD for age of IBD onset, gender, need for surgery, or smoking. In CD, we observed a strong correlation between anti-I2 level (p=0.005) and anti-I2 status (p=0.003) and NAFLD. In UC, ASCA IgG level was associated with NAFLD (p=0.001). CD serological quartile sum analyses revealed a trend towards association with NAFLD (p=0.06). Immunochip analyses revealed association with: metabolic disease genes (LECT2 (hepatokine linking obesity to insulin resistance), CCR5, CAMTA1, GRIP1) and other immune disease loci (TNFRSF1A, IRAK3) with p-values<10 (-5); as well as known IBD genes (CDKAL1, CALM3, vitamin D receptor (VDR), GPR183, IFNGR2/IL10RB (all p<0.05)). GWAS analyses revealed 4 loci p<10 (-5) including MYO5A (an insulin target in adipose tissue) and genes highly expressed in liver (SNTG2). These genes implicate insulin resistance and metabolic disease pathways in NAFLD development in IBD.Table 1: IBD Phenotypic Associations With NAFLDConclusion: NAFLD is associated with raised BMI and metabolic disease genes in IBD as well as stricturing small bowel disease and anti-I2 in CD. These findings may help identify IBD patients at risk of hepatotoxicity from medications such as methotrexate. Further work understanding this relationship is warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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