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Enregistrement W2978080790 · doi:10.29173/aar75

Learning the Science Behind Bacteriocins Through Lacticin 3147; a Promising Lantibiotic

2019· article· en· W2978080790 sur OpenAlexaffvenue
Allison Wan, Cherry Ibarra-Romero, John C. Vederas, Sorina Chiorean

Notice bibliographique

RevueAlberta Academic Review · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLantibioticsBacteriocinNisinAntimicrobialBacteriaBiologyAntimicrobial peptidesChromatographyLactococcus lactisFood scienceMicrobiologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

As microorganisms continue to develop resistance and survive against many different forms of antimicrobial solutions, such as antibiotics, the threat that antimicrobial resistance poses grows considerably. One solution to this persistent issue could be bacteriocins: ribosomally synthesized antimicrobial peptides that are synthesized by bacteria. In this study, the specific lantibiotic—a subclass of bacteriocin—used was lacticin 3147, which is comprised of two components: A1 and A2. Lacticin 3147 was first purified and isolated in order to properly analyze its antimicrobial effects, which show potential use in antibiotics or food preservation. The procedure started with growing the producer bacteria strain, Lactococcus lactis DPC 3147 in a broth which was later used to inoculate a large volume of media. This media was then separated through centrifugation into two components: the supernatant and cell pellet, both of which were each individually concentrated and purified through a series of columns. Approximately one milliliter of each component was run through a High Performance Liquid Chromatography (HPLC) machine, and the resulting chromatograms interpreted to evaluate and compare the concentrations of lacticin 3147 produced in the liquid media portion (supernatant) and the cell components (cell pellet). Subsequently, fractions were collected from all runs from the HPLC and further subjected to Matrix Assisted Laser Desorption Ionization Time of Flight (MALDI TOF) mass spectrometry. This allows to test the molecular weights of the compounds in the samples to check if they aligned with the known molecular weights of both the A1 and A2 components of lacticin 3147. The final step was to prepare a spot on lawn assay using the indicator species: Lactococcus lactis subsp. cremoris HP. The spot on lawn assay prepared for lacticin 3147 was a visual indicator of the strong antimicrobial effects of the bacteriocin. Ultimately, this highly effective bacteriocin, lacticin 3147, could be utilized in smaller concentrations than current antibiotics, and thus shows great promise in the field of antibiotics. Further studies are being conducted to understand the interactions between the A1 and A2 components of lacticin 3147, including their synergistic effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,896
Score d'incertitude au seuil0,696

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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