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Enregistrement W2978130819 · doi:10.1038/s41591-019-0579-z

Genome-wide germline correlates of the epigenetic landscape of prostate cancer

2019· article· en· W2978130819 sur OpenAlexafffund
Kathleen E. Houlahan, Yu-Jia Shiah, Alexander Gusev, Jiapei Yuan, Musaddeque Ahmed, Anamay Shetty, Susmita G. Ramanand, Cindy Q. Yao, Connor Bell, Edward O’Connor, Vincent Huang, Michael Fraser, Lawrence E. Heisler, Julie Livingstone, Takafumi N. Yamaguchi, Alexandre Rouette, Adrien Foucal, Shadrielle M. G. Espiritu, Ankit Sinha, Michelle Sam, Lee E. Timms, Jeremy Johns, Ada Wong, Alex Murison, Michèle Orain, Valérie Picard, Hélène Hovington, Alain Bergeron, Louis Lacombe, Mathieu Lupien, Yves Fradet, Bernard Têtu, John D. McPherson, Bogdan Paşaniuc, Thomas Kislinger, Melvin L.K. Chua, Mark M. Pomerantz, Theodorus van der Kwast, Matthew L. Freedman, Ram S. Mani, Housheng Hansen He, Robert G. Bristow, Paul C. Boutros

Notice bibliographique

RevueNature Medicine · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversité LavalPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health NetworkVector InstituteOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchProstate Cancer CanadaNational Cancer InstituteU.S. Department of Health and Human ServicesGovernment of CanadaTerry Fox Research InstituteMovember Foundation
Mots-clésGermlineProstate cancerEpigeneticsGenomeBiologyGeneticsComputational biologyCancerMedicineBioinformaticsCancer researchGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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