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Enregistrement W2978257108 · doi:10.1039/c9an01642b

Metabolomics for improved treatment monitoring of phenylketonuria: urinary biomarkers for non-invasive assessment of dietary adherence and nutritional deficiencies

2019· article· en· W2978257108 sur OpenAlexafffund
Jennifer Wild, Meera Shanmuganathan, Mika Hayashi, Murray Potter, Philip Britz‐McKibbin

Notice bibliographique

RevueThe Analyst · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcMaster UniversityGenome Canada
Mots-clésUrinary systemMetabolomicsMedicinePhenylketonuriasIntensive care medicineInternal medicineBioinformaticsBiologyPhenylalanineBiochemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Management of phenylketonuria (PKU) requires lifelong restriction of phenylalanine (Phe) intake using specialized medical foods to prevent neurocognitive impairment in affected patients. However, dietary adherence is challenging to maintain while ensuring adequate nutrition, which can lead to sub-optimal clinical outcomes. Metabolomics offers a systematic approach to identify new biomarkers of disease progression in PKU when using urine as a surrogate for blood specimens that is more accurate than self-reported diet records. Herein, the plasma and urine metabolome of a cohort of classic PKU patients (median age = 11 years; n = 22) mainly prescribed (78%) a Phe-restricted diet were characterized using multisegment injection-capillary electrophoresis-mass spectrometry (MSI-CE-MS). Overall, there was good mutual agreement between plasma Phe and tyrosine (Tyr) concentrations measured from PKU patients when using an amino acid analyzer based on UPLC-UV as compared to MSI-CE-MS with a mean bias of 12% (n = 82). Longitudinal measurements of recently diagnosed PKU infants (n = 3) revealed good long-term regulation of blood Phe with dietary management, and only occasional episodes exceeding the recommended therapeutic range (>360 μM) unlike older PKU patients. Plasma metabolomic studies demonstrated that non-adherent PKU patients had lower circulating concentrations of Tyr, arginine, 2-aminobutyric acid, and propionylcarnitine (q < 0.05, FDR) that were inversely correlated to Phe (r ≈ -0.600 to -0.830). Nontargeted metabolite profiling also revealed urinary biomarkers associated with poor dietary adherence among PKU patients, including elevated concentrations of catabolites indicative of Phe intoxication (e.g., phenylpyruvic acid, phenylacetylglutamine, hydroxyphenylacetic acid). Additionally, PKU patients with poor blood Phe control had lower excretion of urinary compounds derived from co-metabolism of Tyr due to microbiota activity (e.g., cresol sulfate, phenylsulfate), as well as several metabolites associated with inadequate nutrient intake, including low carnitine and B vitamin status (e.g., folic acid, vitamin B12). Interestingly, an unknown urinary metabolite was strongly correlated with Phe excretion in PKU patients (r = 0.861), which was subsequently identified as imidazole lactic acid when using high resolution MS/MS. Overall, urine profiling offers a non-invasive approach for better treatment monitoring of individual PKU patients, which can also guide the design of novel therapies that improve adherence to Phe-restricted diets without acquired nutritional deficiencies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,134
Score d'incertitude au seuil0,306

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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