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Enregistrement W2978395522 · doi:10.1016/j.neuroimage.2019.116241

Comparison of resting-state functional connectivity in marmosets with tracer-based cellular connectivity

2019· article· en· W2978395522 sur OpenAlexafffund
Yuki Hori, David J. Schaeffer, Kyle M. Gilbert, Lauren K. Hayrynen, Justine Cléry, Joseph S. Gati, Ravi S. Menon, Stefan Everling

Notice bibliographique

RevueNeuroImage · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada First Research Excellence Fund
Mots-clésResting state fMRICorrelationFunctional connectivityNeuroscienceNegative correlationTRACERBlood-oxygen-level dependentPartial correlationFunctional magnetic resonance imagingPattern recognition (psychology)BiologyComputer scienceArtificial intelligenceMathematicsPhysicsMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Resting-state functional MRI (RS-fMRI) is widely used to assess how strongly different brain areas are connected. However, this connection obtained by RS-fMRI, which is called functional connectivity (FC), simply refers to the correlation of blood oxygen level-dependent (BOLD) signals across time it has yet to be quantified how accurately FC reflects cellular connectivity (CC). In this study, we elucidated this relationship using RS-fMRI and quantitative tracer data in marmosets. In addition, we also elucidated the effects of distance between two brain regions on the relationship between FC and CC across seed region. To calculate FC, we used full correlation approach that is considered to reflect not only direct (monosynaptic connections) but also indirect pathways (polysynaptic connections). Our main findings are that: (1) overall FC obtained by RS-fMRI was highly correlated with tracer-based CC, but correlation coefficients varied remarkably across seed regions; (2) the strength of FC decreased with increase in the distance between two regions; (3) correlation coefficients between FC and CC after regressing out the effects of the distance between two regions still varied across seed regions, but some regions have strong correlations. These findings suggest that although FC reflects the strength of monosynaptic pathways, it is strongly affected by the distance between regions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations61
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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