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Enregistrement W2978420583 · doi:10.1016/j.cryobiol.2019.09.017

Measurement of grouped intracellular solute osmotic virial coefficients

2019· article· en· W2978420583 sur OpenAlexafffund
Michał Zieliński, Locksley E. McGann, John A. Nychka, Janet A.W. Elliott

Notice bibliographique

RevueCryobiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesUniversity of Alberta
Mots-clésVirial coefficientOsmosisIntracellularThermodynamicsChemistryChromatographyPhysicsBiochemistryMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Models of cellular osmotic behaviour depend on thermodynamic solution theories to calculate chemical potentials in the solutions inside and outside the cell. These solutions are generally thermodynamically non-ideal under cryobiological conditions. The molality-based Elliott et al. form of the multi-solute osmotic virial equation is a solution theory which has been demonstrated to provide accurate predictions in cryobiological solutions, accounting for the non-ideality of these solutions using solute-specific thermodynamic parameters called osmotic virial coefficients. However, this solution theory requires as inputs the exact concentration of every solute in the solution being modeled, which poses a problem for the cytoplasm, where such detailed information is rarely available. This problem can be overcome by using a grouped solute approach for modeling the cytoplasm, where all the non-permeating intracellular solutes are treated as a single non-permeating "grouped" intracellular solute. We have recently shown (Zielinski et al., J Physical Chemistry B, 2017) that such a grouped solute approach is theoretically valid when used with the Elliott et al. model, and Ross-Rodriguez et al. (Biopreservation and Biobanking, 2012) have previously developed a method for measuring the cell type-specific osmotic virial coefficients of the grouped intracellular solute. However, the Ross-Rodriguez et al. method suffers from a lack of precision, which-as we demonstrate in this work-can severely impact the accuracy of osmotic model predictions under certain conditions. Thus, we herein develop a novel method for measuring grouped intracellular solute osmotic virial coefficients which yields more precise values than the existing method and then apply this new method to measure these coefficients for human umbilical vein endothelial cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,415

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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