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Enregistrement W2978651765 · doi:10.1002/em.22337

<i>In vivo</i> localization and postmortem stability of benzo[<i>a</i>]pyrene‐DNA adducts

2019· article· en· W2978651765 sur OpenAlexaff
Miriam C. Poirier, Frederick A. Beland, Kathyayini V. Divi, Alyssa L. Damon, Mehnaz Ali, Michelle M. Vanlandingham, Mona I. Churchwell, Linda S. Von Tungeln, Jennifer E. Dwyer, Rao L. Divi, Guy Beauchamp, Daniel Martineau

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarcinogenChemistryPyreneAdductBenzo(a)pyreneDNAMolecular biologyGastrointestinal tractElectrospray ionizationMutagenDNA adductBiochemistryChromatographyMass spectrometryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DNA adducts of carcinogenic polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) play a critical role in the etiology of gastrointestinal tract cancers in humans and other species orally exposed to PAHs. Yet, the precise localization of PAH‐DNA adducts in the gastrointestinal tract, and the long‐term postmortem PAH‐DNA adduct stability are unknown. To address these issues, the following experiment was performed. Mice were injected intraperitoneally with the PAH carcinogen benzo[ a ]pyrene (BP) and euthanized at 24 h. Tissues were harvested either at euthanasia (0 time), or after 4, 8, 12, 24, 48, and 168 hr (7 days) of storage at 4°C. Portions of mouse tissues were formalin‐fixed, paraffin‐embedded, and immunohistochemically (IHC) evaluated by incubation with r7,t8‐dihydroxy‐t‐9,10‐epoxy‐7,8,9,10‐tetrahydrobenzo[ a ]pyrene (BPDE)‐DNA antiserum and H‐scoring. The remaining tissues were frozen, and DNA was extracted and assayed for the r7,t8,t9‐trihydroxy‐c‐10‐( N 2 ‐deoxyguanosyl)‐7,8,9,10‐tetrahydrobenzo[ a ]pyrene (BPdG) adduct using two quantitative assays, the BPDE‐DNA chemiluminescence immunoassay (CIA), and high‐performance liquid chromatography electrospray ionization tandem mass spectrometry (HPLC‐ES‐MS/MS). By IHC, which required intact nuclei, BPdG adducts were visualized in forestomach basal cells, which included gastric stem cells, for up to 7 days. In proximal small intestine villus epithelium BPdG adducts were visualized for up to 12 hr. By BPDE‐DNA CIA and HPLC‐ES‐MS/MS, both of which used DNA for analysis and correlated well ( P = 0.0001), BPdG adducts were unchanged in small intestine, forestomach, and lung stored at 4°C for up to 7 days postmortem. In addition to localization of BPdG adducts, this study reveals the feasibility of examining PAH‐DNA adduct formation in wildlife species living in colder climates. Environ. Mol. Mutagen. 61:216–223, 2020. © 2019 Wiley Periodicals, Inc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,625

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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