Amplification of the Prolactin Receptor Gene in Mammary Lobular Neoplasia.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background: Lobular carcinoma in situ (LCIS) has long been considered a marker of increased risk of cancer in both breasts. However, recent studies have shown that it can behave as a non-obligate precursor lesion as well. The biology and natural history of LCIS still remains ill defined in part because it is a challenging lesion to study as it usually does not have an identifiable gross appearance and is only recognized in fixed tissue specimens.Material and Methods: Using array comparative genomic hybridization (aCGH) we have analyzed regions of amplification found in LCIS and adjacent invasive lobular carcinoma (ILC) in a series of thirteen cases of archival patient samples from our institution. Degenerate oligonucleotide primed (DOP) PCR was performed for whole genome amplification of the extracted DNA from microdissected tissue samples prior to microarray analysis. Analysis of microarray data was performed using Significance Analysis of Microarrays (SAM). Of the ten most amplified genes in LCIS (highest SAM scores), one was selected for quantitative real time PCR (Q-PCR) validation due to the limited amount of material available from these cases. Q-PCR validation was performed on samples from 8 cases of LCIS and invasive lobular carcinoma and 12 archival cases of ductal carcinoma in situ (DCIS) and invasive ductal carcinoma (IDC) for comparison.Results: Amongst the 10 genes with the highest SAM scores, the prolactin receptor gene (PRLR) was selected for further Q-PCR validation in our limited samples. Amplification of PRLR was confirmed by Q-PCR in 4/8 (50%) of cases of LCIS and 4/8 (50%) cases of ILC, compared to 0/12 (0%) cases of DCIS and 3/12 (25%) cases of IDC. When LCIS and ILC were combined into one group, there was more amplification of the prolactin receptor gene when compared to the DCIS and IDC group (p= 0.01). The level of amplification between the two groups also differed in the range of copy number values, which was lower in the ductal group (0.78-1.58, n=24) compared to the lobular group (0.92-3.68, n=16) (p<0.05).Conclusion: We have identified the prolactin receptor as a potential molecular target in lobular neoplasia using array comparative genomic hybridization. In contrast, we have shown that the prolactin receptor may not be as important for the progression of ductal lesions. These results support the view that lobular and ductal carcinoma evolve along separate pathways. Validation of the expression of PRLR in a larger number of LCIS cases is warranted. Citation Information: Cancer Res 2009;69(24 Suppl):Abstract nr 4151.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».