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Enregistrement W2978959544 · doi:10.1242/dmm.040782

Targeted knockout of GABA receptor gamma 2 subunit provokes transient light-induced reflex seizures in zebrafish larvae

2019· article· en· W2978959544 sur OpenAlexafffund
Meijiang Liao, Uday P. Kundap, Richard Rosch, Dominic R. W. Burrows, Martin P. Meyer, Bouchra Ouled Amar Bencheikh, Patrick Cossette, Éric Samarut

Notice bibliographique

RevueDisease Models & Mechanisms · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiquePhotoreceptor and optogenetics research
Établissements canadiensMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de MontréalMontreal Neurological Institute and HospitalUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéRare Disease FoundationWellcome TrustWellcome
Mots-clésZebrafishKnockout mouseProtein subunitNeuroscienceGABAA receptorReflexReceptorCell biologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epilepsy is the most common primary neurological disorder characterized by the chronic tendency of a patient to experience epileptic seizures, which are abnormal body movements or cognitive states that result from excessive, hypersynchronous brain activity. Epilepsy has been found to have numerous etiologies and whilst about two thirds of epilepsies were classically considered idiopathic, a majority of those is now believed to be of genetic origin. Mutations in genes involved in GABA-mediated inhibitory neurotransmission have been associated with a broad range of epilepsy syndromes. Mutations in the GABA-A receptor gamma 2 subunit gene (GABRG2), for example, have been associated with absence epilepsy and febrile seizures in humans. Several rodent models of GABRG2 loss-of-function depict clinical features of the disease, however, alternative genetic models more amenable for the study of ictogenesis and for high-throughput screening purposes are still needed. In this context, we generated a gabrg2 knock-out zebrafish model (R23X) that displayed light/dark-induced reflex seizures. Through high-resolution in vivo calcium imaging of the brain, we showed that this phenotype is associated with widespread increases in neuronal activity that can be effectively alleviated by the anti-epileptic drug valproic acid. Moreover these seizures only occur at the larval stages but disappear after one week of age. Interestingly, our whole transcriptome analysis showed that gabrg2-KO does not alter the expression of genes in the larval brain. As a result, gabrg2-/- zebrafish is a novel in vivo genetic model of early epilepsies that opens new doors to investigate ictogenesis and for further drug-screening assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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