A modifier in the 129S2/SvPasCrl genome is responsible for the viability of Notch1[12f/12f] mice
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Mouse NOTCH1 carries a highly conserved O-fucose glycan at Thr466 in epidermal growth factor-like repeat 12 (EGF12) of the extracellular domain. O-Fucose at this site has been shown by X-ray crystallography to be recognized by both DLL4 and JAG1 Notch ligands. We previously showed that aNotch1Thr466Ala mutant exhibits very little ligand-induced NOTCH1 signaling in a reporter assay, whereas a Thr466Ser mutation enables the transfer of O-fucose and reverts the NOTCH1 signaling defect. We subsequently generated a mutant mouse with the Thr466Ala mutation termedNotch1[12f](Notch1tm2Pst). Surprisingly, homozygousNotch1[12f/12f] mutants on a mixed background were viable and fertile. Results We now report that after backcrossing to C57BL/6 J mice for 11–15 generations, few homozygousNotch1[12f/12f] embryos were born. Timed mating showed that embryonic lethality occurred by embryonic day (E) ~E11.5, somewhat delayed compared to mice lackingNotch1orPofut1(the O-fucosyltransferase that adds O-fucose to Notch receptors), which die at ~E9.5. The phenotype of C57BL/6 JNotch1[12f/12f] embryos was milder than mutants affected by loss of a canonical Notch pathway member, but disorganized vasculogenesis in the yolk sac, delayed somitogenesis and development were characteristic. In situ hybridization of Notch target genesUncx4.1andDll3or western blot analysis of NOTCH1 cleavage did not reveal significant differences at E9.5. However, qRT-PCR of head cDNA showed increased expression ofDll3,Uncx4.1andNotch1in E9.5Notch1[12f/12f] embryos. Sequencing of cDNA fromNotch1[12f/12f] embryo heads and Southern analysis showed that theNotch1[12f] locus was intact following backcrossing. We therefore looked for evidence of modifying gene(s) by crossing C57BL/6 JNotch1[12f/+] mice to 129S2/SvPasCrl mice. Intercrosses of the F1 progeny gave viable F2Notch1[12f/12f] mice. Conclusion We conclude that the 129S2/SvPasCrl genome contains a dominant modifying gene that rescues the functions of NOTCH1[12f] in signaling. Identification of the modifying gene has the potential to illuminate novel factor(s) that promote Notch signaling when an O-fucose glycan is absent from EGF12 of NOTCH1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,018 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».