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Enregistrement W2979235693 · doi:10.1111/jfbc.13071

Enzymatic release of dipeptidyl peptidase‐4 inhibitors (gliptins) from pigeon pea (<i>Cajanus cajan</i>) nutrient reservoir proteins: In silico and in vitro assessments

2019· article· en· W2979235693 sur OpenAlexafffund
Ruth T. Boachie, Faith L. Okoro, Kento Imai, Lu Sun, Sunday Elom, Joseph O. Nwankwo, Chukwunonso E.C.C. Ejike, Chibuike C. Udenigwe

Notice bibliographique

RevueJournal of Food Biochemistry · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Hydrolysis and Bioactive Peptides
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIn silicoThermolysinPapainHydrolysateBiochemistryCajanusChemistryProteomeDipeptidyl peptidaseProteasesEnzymeBiologyComputational biologyHydrolysisTrypsin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In silico and in vitro parameters were used to assess the potential of pigeon pea (Cajanus cajan) nutrient reservoir proteins as sources of dipeptidyl peptidase (DPP)-4 inhibitors. In silico, 40 pigeon pea proteins evaluated had 46% of amino acids associated with DPP-4 inhibition. After virtual hydrolysis, pepsin had the highest frequency of release and bioactivity of released DPP-4 inhibiting peptides, compared to papain and thermolysin. In vitro, thermolysin released the most active DPP-4 inhibitors. The protein hydrolysates contained similar amino acids but different particle sizes. Thus, the bioactivity patterns are attributable to the different nature and behavior of proteins/peptides under actual and virtual conditions. Using eight physicochemical variables, a random forest model with moderate prediction accuracy was developed for predicting DPP-4 inhibitory activity of papain hydrolysates. The findings demonstrate that proteins from pigeon pea are precursors of DPP-4 inhibitors, with potential use in formulating functional food for managing type 2 diabetes. PRACTICAL APPLICATIONS: The emerging use of in silico simulations to predict bioactivity of peptides can provide a framework to direct further wet lab assessments. This pattern can enhance focusing on factors relevant to the bioactive properties of interest. However, there is still limited evidence to confirm the reliability and accuracy of this tool. This study therefore provides insight into the practical use of in silico simulations to predict bioactivity of food peptides by assessing the factors relevant to the enzymatic release of dipeptidyl peptidase-4 inhibitors from pigeon pea seed storage proteins and validating the findings with wet lab assessment. This work also provides important information that can enhance the utilization of pigeon pea, which is an orphan crop, in developing functional food products for managing type 2 diabetes mellitus in developing countries.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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