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Enregistrement W2979328224 · doi:10.1002/humu.23929

Clinical spectrum of individuals with pathogenic <i> <b>N</b> F1 </i> missense variants affecting p.Met1149, p.Arg1276, and p.Lys1423: genotype–phenotype study in neurofibromatosis type 1

2019· article· en· W2979328224 sur OpenAlex
Magdalena Koczkowska, Tom Callens, Yunjia Chen, Alicia Gomes, Alesha D. Hicks, Angela Sharp, Eric Johns, Kim Uhas, Linlea Armstrong, Katherine A. Bosanko, Dusica Babovic‐Vuksanovic, Laura Baker, Donald Basel, Mario Bengala, James T. Bennett, Chelsea Chambers, L. Kate Clarkson, Maurizio Clementi, Fanny Cortés, Mitch Cunningham, Daniela D’Agostino, Martin B. Delatycki, M. Cristina Digilio, Laura Dosa, Silvia Esposito, Stéphanie Fox, Mary‐Louise Freckmann, Christine Fauth, Teresa Giugliano, Sandra Giustini, Allison L. Goetsch, Yael Goldberg, Robert Greenwood, Cristin Griffis, Karen W. Gripp, Punita Gupta, Eric Haan, Rachel K. Hachen, Tamara L. Haygarth, Concepción Hernández‐Chico, Katelyn Hodge, Robert J. Hopkin, Louanne Hudgins, Sandra Janssens, Kory Keller, Geraldine Kelly‐Mancuso, Aaina Kochhar, Bruce R. Korf, Andrea M. Lewis, Jan Liebelt, Angie Lichty, Robert Listernick, Michael J. Lyons, Isabelle Maystadt, Mayra Martinez Ojeda, Carey McDougall, Lesley McGregor, Daniela Melis, Nancy J. Mendelsohn, Małgorzata J.M. Nowaczyk, June Ortenberg, Karin Panzer, John Pappas, Mary Ella Pierpont, Giulio Piluso, Valentina Pinna, Enikö K. Pivnick, Dinel Pond, Cynthia M. Powell, Caleb Rogers, Noa Ruhrman‐Shahar, S. Lane Rutledge, Veronica Saletti, Sarah A. Sandaradura, Claudia Santoro, Ulrich A. Schatz, Allison Schreiber, Daryl A. Scott, Elizabeth A. Sellars, Ruth Sheffer, Elizabeth Siqveland, John M. Slopis, Rosemarie Smith, Alberto Spalice, David W. Stockton, Haley Streff, Amy Theos, Gail E. Tomlinson, Grace Tran, Pamela Trapane, Eva Trevisson, Nicole J. Ullrich, Jenneke van den Ende, Samantha A. Schrier Vergano, Stephanie E Wallace, Michael F. Wangler, David D. Weaver, Kaleb Yohay, Elaine H. Zackai, Jonathan Zonana, Vickie Zurcher, Kathleen Claes, Marica Eoli, Yolanda Martín, Katharina Wimmer, Alessandro De Luca, Eric Legius, Ludwine Messiaen

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurofibromatosis and Schwannoma Cases
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcMaster UniversityB.C. Women's Hospital & Health CentreMcMaster University Medical CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development
Mots-clésMissense mutationNeurofibromatosisCohortBiologyPhenotypeGenotypeGeneticsPopulationInternal medicineGastroenterologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report 281 individuals carrying a pathogenic recurrent NF1 missense variant at p.Met1149, p.Arg1276, or p.Lys1423, representing three nontruncating NF1 hotspots in the University of Alabama at Birmingham (UAB) cohort, together identified in 1.8% of unrelated NF1 individuals. About 25% (95% confidence interval: 20.5-31.2%) of individuals heterozygous for a pathogenic NF1 p.Met1149, p.Arg1276, or p.Lys1423 missense variant had a Noonan-like phenotype, which is significantly more compared with the "classic" NF1-affected cohorts (all p < .0001). Furthermore, p.Arg1276 and p.Lys1423 pathogenic missense variants were associated with a high prevalence of cardiovascular abnormalities, including pulmonic stenosis (all p < .0001), while p.Arg1276 variants had a high prevalence of symptomatic spinal neurofibromas (p < .0001) compared with "classic" NF1-affected cohorts. However, p.Met1149-positive individuals had a mild phenotype, characterized mainly by pigmentary manifestations without externally visible plexiform neurofibromas, symptomatic spinal neurofibromas or symptomatic optic pathway gliomas. As up to 0.4% of unrelated individuals in the UAB cohort carries a p.Met1149 missense variant, this finding will contribute to more accurate stratification of a significant number of NF1 individuals. Although clinically relevant genotype-phenotype correlations are rare in NF1, each affecting only a small percentage of individuals, together they impact counseling and management of a significant number of the NF1 population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,812

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle