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Enregistrement W2979370317 · doi:10.1101/802728

Critical role for Slam/SAP signaling in the thymic developmental programming of IL-17- and IFN-γ-producing γδ T cells

2019· preprint· en· W2979370317 sur OpenAlexaff
Oliver Dienz, Victoria L. DeVault, Shawn C. Musial, Somen K Mistri, Linda Mei, Aleksandr Baraev, Julie A. Dragon, Dimitry N. Krementsov, André Veillette, Jonathan E. Boyson

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyT cellBiologyCD44Signal transductionCD24T-cell receptorCellImmunologyBiochemistryImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract During thymic development, γδ T cells commit to either an IFN-γ- or an IL-17-producing phenotype through mechanisms that remain unclear. Here, we investigated whether the SLAM/SAP signaling pathway played a role in the functional programming of thymic γδ T cells. Characterization of SLAM family receptor expression revealed that thymic γδ T cell subsets were each marked by distinct co-expression profiles of SLAMF1, SLAMF4, and SLAMF6. In the thymus, immature CD24 hi Vγ1 and Vγ4 γδ T cells were largely contained within a SLAMF1 + SLAMF6 + double positive (DP) population, while mature CD24 low subsets were either SLAMF1 + or SLAMF6 + single positive (SP) cells. In the periphery, SLAMF1 and SLAMF6 expression on Vγ1, Vγ4, and Vγ6 T cells distinguished IL-17- and IFN-γ-producing subsets, respectively. Disruption of SLAM family receptor signaling through deletion of SAP resulted in impaired thymic γδ T cell maturation at the CD24 hi SLAMF1 + SLAMF6 + DP stage that was associated with a decreased frequency of CD44 + RORγt + γδ T cells. These defects were in turn associated with impaired γδ T cell IL-17 and IFN-γ production in both the thymus as well as in peripheral tissues. The role for SAP was subset-specific, as Vγ1, Vγ4, Vγ5, but not Vγ6 subsets were SAP-dependent. Together, these data suggest that the SLAM/SAP signaling pathway regulates a critical checkpoint in the functional programming of IL-17 and IFN-γ-producing γδ T cell subsets during thymic development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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