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Enregistrement W2979402400 · doi:10.1093/infdis/jiz258

Guidance for Studies Evaluating the Accuracy of Sputum-Based Tests to Diagnose Tuberculosis

2019· article· en· W2979402400 sur OpenAlexaff
Samuel G. Schumacher, William A. Wells, Mark P. Nicol, Karen R Steingart, Grant Theron, Susan E. Dorman, Madhukar Pai, Gavin Churchyard, Lesley Scott, Wendy Stevens, Pamela Nabeta, David Alland, Karin Weyer, Claudia M. Denkinger, Christopher Gilpin

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesSouth African Medical Research CouncilEuropean CommissionWorld Health Organization
Mots-clésMedicineSputumTuberculosisGeneralizability theoryTest (biology)PopulationTuberculosis diagnosisComparabilityClinical study designMedical physicsIntensive care medicinePathologyClinical trialMycobacterium tuberculosisStatisticsEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tests that can replace sputum smear microscopy have been identified as a top priority diagnostic need for tuberculosis by the World Health Organization. High-quality evidence on diagnostic accuracy for tests that may meet this need is an essential requirement to inform decisions about policy and scale-up. However, test accuracy studies are often of low and inconsistent quality and poorly reported, leading to uncertainty about true test performance. Here we provide guidance for the design of diagnostic test accuracy studies of sputum smear-replacement tests. Such studies should have a cross-sectional or cohort design, enrolling either a consecutive series or a random sample of patients who require evaluation for tuberculosis. Adults with respiratory symptoms are the target population. The reference standard should at a minimum be a single, automated, liquid culture, but additional cultures, follow-up, clinical case definition, and specific measures to understand discordant results should also be included. Inclusion of smear microscopy and Xpert MTB/RIF (or MTB/RIF Ultra) as comparators is critical to allow broader comparability and generalizability of results, because disease spectrum can vary between studies and affects relative test performance. Given the complex nature of sputum (the primary specimen type used for pulmonary TB), careful design and reporting of the specimen flow is essential. Test characteristics other than accuracy (such as feasibility, implementation considerations, and data on impact on patient, population and health systems outcomes) are also important aspects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,168
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,477
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,168
Score d'incertitude au seuil0,890

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1680,477
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0050,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,017
Bibliométrie0,0150,010
Études des sciences et des technologies0,0020,004
Communication savante0,0060,007
Science ouverte0,0140,005
Intégrité de la recherche0,0320,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0240,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,063
Tête enseignante GPT0,438
Écart entre enseignants0,376 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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