CD34, CD56 and CD2 Are Predictive of NPM1 Mutation, FLT3-ITD and Their Favorable Prognosis Combination in Cytogenetically Normal Acute Myeloid Leukemia.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Abstract 1576 Poster Board I-602 Introduction In cytogenetically normal acute myeloid leukemias (CN-AML), mutations of nucleophosmin (NPM1) gene and internal tandem deletion of Fms-related tyrosine kinase 3 (FLT3-ITD) are used to stratify them into prognostically distinct groups: CN-AML patients with mutated NPM1 (NPM1-mt) and wild type FLT3 (FLT3-wt) form a group with favorable prognosis, whereas those with wild type NPM1 (NPM1-wt) and FLT3-ITD make up the less favorable prognosis group. FLT3 mutations in tyrosine kinase domain (FLT3-TKD) are much less common and their prognostic significance is uncertain. Molecular testing for these abnormalities is expensive, time consuming and not widely available. Methods We have retrospectively correlated flow cytometric profile of patients with CN-AML with abnormalities of NPM1 and FLT3, in 79 unselected CN-AML patients between the ages of 19 and 60, and who also had blast cell DNA available for determination of FLT-3 and NPM1 mutation status. The FLT3-ITD was detected by DNA PCR and the NPM1 mutation and FLT-3 point mutation by direct sequencing of exons 12 and exon 20, respectively. The 4-color flow cytometry was performed using some or all of the following antibodies: HLA-DR, CD2, CD3, CD4, CD5, CD7, CD8, CD10, CD11b, CD11c, CD13, CD14, CD15, CD19, CD20, CD22, CD33, CD34, CD45, CD56, CD61, CD64, CD71, CD79a, CD117, TDT, and MPO. All the plots were reviewed by two investigators (BD, MM) and listmode files reanalyzed as necessary. The antigen expression was recorded as negative/positive, dim/moderate/bright and partial/complete and correlated with NPM1-mt, FLT3-ITD and FLT3-TKD using 2×2 contingency tables and Fisher's exact test. Results 42 (53%), 34(43%) and 5 (6%) of 79 patients were NPM1-wt, FLT3-ITD and FLT3-TKD respectively. NPM-wt patients were more likely to be CD34+ (93%, p<0.0001, positive predictive value 89%, see figure); moreover, all patients with aberrant expression of CD2 (n=6) were NPM-wt (p=0.028). FLT3-ITD patients were more likely to be CD56+ (62%, p=0.02). 15/79 (19%) patients had unfavorable combination of NPM1-wt / FLT3-ITD, while 18 (23%) had favorable combination of NPM1-mt / FLT3-wt. The other two combinations NPM1-mt / FLT3-ITD and NPM1-wt / FLT3-wt had 19 (24%) and 27 (34%) patients respectively. Those with favorable combination were more likely to be CD56- (93%, p=0.0062, see figure), than all others. The patients with FLT3-TKD tended to be CD19+ (3/5) compared to those without TKD (15/71); however, due to low frequency of this mutation, the data is not statistically significant (p=0.0831). The remaining antigens, the intensity of staining and duality of populations (only a subpopulation positive) did not correlate NPM1 or FLT3 gene aberrations, nor with any of their combinations. Conclusions In CN-AML patients, flow cytometric demonstration of CD2+ and CD34- can predict NPM1-mt, while CD56+ can predict FLT3-ITD. CD56 can also identify the patients with favorable combination of NPM1-mt/FLT3-wt. Disclosures No relevant conflicts of interest to declare.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».