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Enregistrement W2979545998 · doi:10.1016/j.neuroimage.2019.116278

Common functional networks in the mouse brain revealed by multi-centre resting-state fMRI analysis

2019· article· en· W2979545998 sur OpenAlexaff
Joanes Grandjean, Carola Canella, Cynthia Anckaerts, Gülebru Ayrancı, Salma Bougacha, Thomas Bienert, David Buehlmann, Ludovico Coletta, Daniel Gallino, Natalia Gass, Clément M. Garin, Nachiket A. Nadkarni, Neele S. Hübner, Meltem Karatas, Yuji Komaki, Silke Kreitz, Francesca Mandino, Anna E. Mechling, Chika Sato, Katja Sauer, Disha Shah, Sandra Strobelt, Norio Takata, Isabel Wank, Tong Wu, Noriaki Yahata, Ling Yun Yeow, Yohan Yee, Ichio Aoki, M. Mallar Chakravarty, Wei‐Tang Chang, Marc Dhénain, Dominik von Elverfeldt, Laura Harsan, Andreas Heß, Tianzi Jiang, Georgios A. Keliris, Jason P. Lerch, Andreas Meyer‐Lindenberg, Hideyuki Okano, Markus Rudin, Alexander Sartorius, Annemie Van der Linden, Marleen Verhoye, Wolfgang Weber‐Fahr, Nicole Wenderoth, Valerio Zerbi, Alessandro Gozzi

Notice bibliographique

RevueNeuroImage · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenSickKids FoundationUniversity of TorontoDouglas Mental Health University InstituteMcGill University
Organismes subventionnairesJapan Science and Technology AgencyJapan Society for the Promotion of ScienceVlaamse regeringDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsBundesministerium für Bildung und ForschungBpifranceExploratory Research for Advanced TechnologyNational Alliance for Research on Schizophrenia and DepressionEuropean CommissionFonds Wetenschappelijk OnderzoekJapan Agency for Medical Research and DevelopmentSimons FoundationMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyAgence Nationale de la RechercheSimons Foundation Autism Research InitiativeBrain and Behavior Research Foundation
Mots-clésResting state fMRIDefault mode networkComputer scienceFunctional magnetic resonance imagingFunctional connectivityNeuroimagingMedetomidineNeuroscienceArtificial intelligencePattern recognition (psychology)MedicinePsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Preclinical applications of resting-state functional magnetic resonance imaging (rsfMRI) offer the possibility to non-invasively probe whole-brain network dynamics and to investigate the determinants of altered network signatures observed in human studies. Mouse rsfMRI has been increasingly adopted by numerous laboratories worldwide. Here we describe a multi-centre comparison of 17 mouse rsfMRI datasets via a common image processing and analysis pipeline. Despite prominent cross-laboratory differences in equipment and imaging procedures, we report the reproducible identification of several large-scale resting-state networks (RSN), including a mouse default-mode network, in the majority of datasets. A combination of factors was associated with enhanced reproducibility in functional connectivity parameter estimation, including animal handling procedures and equipment performance. RSN spatial specificity was enhanced in datasets acquired at higher field strength, with cryoprobes, in ventilated animals, and under medetomidine-isoflurane combination sedation. Our work describes a set of representative RSNs in the mouse brain and highlights key experimental parameters that can critically guide the design and analysis of future rodent rsfMRI investigations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations235
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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