MOLECULAR AND CELLULAR MECHANISMS REGULATING EPIGENETIC CELL CONVERSION
Notice bibliographique
Résumé
Phenotype definition is controlled by epigenetic regulations that allow cells to acquire their differentiated state. The process is reversible and cells can be driven back to a higher plasticity state with several different approaches, which include the interaction with the epigenetic set up through the use of epigenetic erasers, readers or writers. Among the many epigenetic modifiers presently available, in our previous experiments, we selected 5-azacytidine (5-aza-CR), which is a well-known DNA methyltransferase inhibitor, and has been previously shown to increase cell plasticity and facilitate phenotype changes in different cell types. Beside the epigenetic mechanisms driving cell conversion processes, growing evidences highlight the importance of mechanical forces that directly influence cell plasticity and differentiation. Aims of my PhD were: a) characterization of the molecular and cellular mechanisms regulating cell phenotype b) analysis of the possible relation between mechano-sensing and epigenetic control of cell plasticity and differentiation. The experiments carried out confirmed the global demethylating effect of 5-aza-CR, with a transient upregulation of pluripotency markers. At the same time increased transcription of TET2 and several histones was detected. This was accompanied by changes in enzymes controlling histone acetylation and cell morphological rearrangement. Interestingly, the study of DNA methylation profile and its regulatory genes, revealed that the use of a 3D micro-bioreactor promotes and stabilizes the maintenance of the acquired plasticity for a long period of culture. In particular, the use of an adequate soft substrate increased pancreatic conversion efficiency and induced the acquisition of a mono-hormonal phenotype, which is distinctive of terminally matured cell. Altogether these findings indicate that 5-aza-CR induced somatic cell transition to a higher plasticity state may be the result of multiple regulatory mechanisms that accompany the demethylating effect exerted by the modifier. The results described in my thesis also revealed that mechano-transduction-related responses modulate and maintain 5-aza- CR induced cell plasticity and significantly improve cell differentiation toward the pancreatic lineage.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».