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Enregistrement W2980002435 · doi:10.14309/01.ajg.0000600756.53818.38

2806 Viral-Induced Acute Pancreatitis: A Systematic Review

2019· review· en· W2980002435 sur OpenAlexaboutno aff
Zaid Imam, C. Roberto Simons-Linares, Prabhleen Chahal

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Gastroenterology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatitis Pathology and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineEtiologyInternal medicineAcute pancreatitisViral hepatitisSerologyPancreatitisGastroenterologyEnglish languageImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Infectious (viral, bacterial, and fungal) etiologies are rare causes of acute pancreatitis (AP). We sought to investigate the frequency of viral-induced AP (VIAP), describe its natural course, and clinical features. METHODS: A comprehensive review of PubMed’s database of English language from the time of its inception and until April 12 th ,2019 was performed using all relevant MeSH (medical subject headings) keywords. AP diagnosis and severity were defined as per the Revised Atlanta Classification (RAC). Viral infections were diagnosed by serology and/or histology. A diagnosis of viral infection, with a concurrent AP diagnosis, a temporal resolution of both entities and the attempt to exclude the most common etiologies of AP defined VIAP. Graft pancreatitis studies and non-English publications were excluded. Two independent blinded reviewers (Z.I, C.R.S.L.) reviewed the publications. Bias risk was assessed with the Murad tool derived from the Newcastle-Ottawa scale. RESULTS: 209 cases were identified in 128 publications meeting criteria for VIAP and were reviewed (2 case control, 120 case reports, 6 case series) (Figure 1). Most studies 101 (78.3%) were at high risk of bias. Mean age was 38.9 ± 1.28 yrs for 170 patients. Male to female ratio was 2.2:1, and 52 (28.0%) of 186 patients were immunocompromised. Mean lipase was 1590 (range: 61-16879) and mean amylase was 1237 (range: 33-14800) in 103 and 156 patients. Viral hepatitis (A,B,C,D and E) was the most common virus and accounted for 34.4% of reported cases, followed by coxsackie and echoviruses at 14.8%, hemorrhagic fever viruses at 12.4%, CMV at 12.0%, VZV at 10.5%, mumps and measles at 3.8%, primary HIV infection at 3.8%, HSV at 1.9%, EBV at 1.9% and the remainder of cases (1.9%) attributed to adenovirus, influenza H1N1, and multiple viruses were implicated in 1% of cases. Severity of AP was: 43.1% mild, 11.7% moderately severe, 32.4% severe. Death was reported in 42 (20.1%) patients. Patient characteristics are summarized in Table 1. CONCLUSION: Although majority of patients were not immunocompromised (72%), a significant portion were immunocompromised (28.0%). Importantly, among those who died, 71.4% were immunocompromised. Mortality rate was higher than that reported for AP from other etiologies in the literature. Cholangiopathy and obstruction, direct acinar injury by viral replication are suggested pathogenesis mechanisms for virus attributed AP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,018
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,018
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0060,004
Bibliométrie0,0140,016
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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