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Enregistrement W2980007401 · doi:10.1182/blood.v120.21.1470.1470

TYK2-STAT1 Pathway Positively Regulates BCL2 Gene Expression in T-Cell Acute Lymphoblastic Leukemia

2012· article· en· W2980007401 sur OpenAlexaff
Takaomi Sanda, Jeffrey Tyner, Alejandro Gutiérrez, Vu N. Ngo, Jason Glover, Bill H. Chang, Arla Yost, Andrew P. Weng, Wenxue Ma, Jessica Tatarek, Angela G. Fleischman, Yebin Ahn, Yandan Yang, Wenjun Zhou, Donna Neuberg, Richard Moriggl, Mathias Müller, Michelle A. Kelliher, Catriona Jamieson, Nathanael S. Gray, Louis M. Staudt, Brian Druker, Thomas Look

Notice bibliographique

RevueBlood · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Lymphoblastic Leukemia research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTyrosine kinase 2Gene knockdownGene silencingBiologySTAT1RNA interferenceSmall hairpin RNAEffectorSignal transductionCancer researchMolecular biologyCell biologyCell cultureGeneGeneticsReceptorRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 1470 To discover oncogenic pathways that are characteristically deregulated in T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL), we performed RNA interference screens both in T-ALL cell lines and primary specimens. We found that the JAK tyrosine kinase family member, TYK2, and its downstream effector, STAT1, are each required for the survival of T-ALL cells. To identify the effector molecules downstream of the TYK2-STAT1 pathway in T-ALL, we analyzed global gene expression profiles in TYK2-dependent T-ALL cell lines after silencing of TYK2 or STAT1. As expected, gene set enrichment analysis revealed that genes downregulated by TYK2 knockdown were generally also downregulated by knockdown of STAT1. Importantly, we found that expression of the anti-apoptotic gene BCL2 was significantly downregulated after silencing of both TYK2 and STAT1. Analysis by quantitative PCR of additional T-ALL cell lines revealed that silencing of TYK2 resulted in significant reductions of BCL2 mRNA expression in multiple TYK2-dependent cell lines. Expression of the wild-type but not the kinase-dead TYK2 protein was sufficient to rescue BCL2 protein expression and to prevent apoptosis after knockdown of endogenous TYK2, indicating that the tyrosine kinase activity of TYK2 is required for BCL2 upregulation. Similarly, expression of the shRNA-resistant wild-type STAT1A protein partially rescued BCL2 protein expression and prevented apoptosis, while a variant of STAT1A (Y701F) that is incapable of becoming phosphorylated on a requisite tyrosine residue did not rescue BCL2 levels. Taken together, our findings indicate that aberrant activation of a TYK2-STAT1 pathway upregulates BCL2 expression in T-ALL cells, and that the T-ALL cells develop pathway dependence, in that they require these sustained high levels BCL2 expression for survival. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
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Résumé présentoui

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