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Enregistrement W2980027737 · doi:10.1182/blood.v108.11.1580.1580

A New Generation of γGlobin Gene Inducers Act on Novel Molecular and Cellular Targets.

2006· article· en· W2980027737 sur OpenAlexaff
Susan P. Perrine, Marie Trudel, Serguei A. Castañeda, Rishikesh Mankidy, Michael S. Boosalis, Marthe-Sandrine Eiymo, Gary L. White, Regine S. Bohacek, Douglas V. Faller

Notice bibliographique

RevueBlood · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHemoglobinopathies and Related Disorders
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésButyrateGlobinBiologyFetal hemoglobinMolecular biologyBiochemistryFetusGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract High-potency, non-cytotoxic oral therapeutics to stimulate both fetal globin expression and erythropoiesis are needed for optimal definitive therapy of the beta-hemoglobinopathies and thalassemias. Butyrate and phenylbutyrate have been the most active of the non-chemotherapy inducing agents, but their efficacy is limited by anti-proliferative effects. A discovery program to identify more potent fetal-globin inducing compounds has been pursued utilizing pharmacophore and pseudoreceptor models to screen chemical libraries for additional inducing agents, based initially on short chain fatty acid derivatives. From a library of 10,000 compounds, our pseudoreceptor model predicted that 30 candidate compounds would bind a structural receptor which results in induction of the γ globin gene promoter. Of the 30 candidates, two compounds (RB 4 and 9) were found to have inducing activity comparable to butyrate in reporter gene assays (producing 2-fold induction), two candidates (RB7 and 29) had higher potency (3–4 fold induction), and 9 compounds had intermediate (lower) inducing activity. Second, five compounds identified through the molecular modeling stimulated proliferation of cord blood erythroid progenitors significantly, even in the absence of any added cytokines. Four of the novel compounds induced fetal globin mRNA (assayed by RT-PCR) in erythroid progenitors by 1.5 to 7-fold over control cells, at concentrations one log lower than previously identified inducers, while butyrate induced γ mRNA by 2-fold but reduced erythroid colony growth by 15%. Of compounds studied in vivo, three candidate compounds induced γ globin mRNA (by 2 to 6-fold) over basal levels in baboons, or by 2–15-fold in mice transgenic for the human γ globin genes. Molecular mechanisms of fetal globin induction by the high-potency compound RB7 resulted from displacement of an HDAC3/NCoR repressor complex from the γ globin promoter, with concurrent local histone acetylation, binding of a remodeling complex, and recruitment of RNA Pol II. These studies together identify 1) novel therapeutic targets, and 2) therapeutic candidates with multiple beneficial actions for treating beta globin disorders and other anemias. Development of a high-potency, orally tolerable therapeutic to benefit even severely anemic thalassemia patients should now be feasible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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