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Enregistrement W2980138548 · doi:10.3138/jammi.2019-0003

Challenges establishing a multi-purpose fecal microbiota transplantation stool donor program in Toronto, Canada

2019· article· en· W2980138548 sur OpenAlexaffvenueabout
Susy Hota, Isabella McNamara, Robbie Jin, Melissa Kissoon, Satyender Singh, Susan M. Poutanen

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensSinai Health SystemUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineClostridium difficileTransplantationCarriageFecal bacteriotherapyIntensive care medicineAntibioticsInternal medicineMicrobiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: The success of fecal microbiota transplantation (FMT) programs depends on maintaining suitable stool donors. We describe challenges recruiting and retaining universal donors in the first 2 years of an FMT clinical and research program in Toronto and identify opportunities for improvement. Methods: A four-stage screening process is used to identify suitable FMT donors in the Microbiota Therapeutics Outcomes Program. Donor screening follows Health Canada recommendations and excludes persons with history or risk for diseases associated with dysbiosis. Donors are rescreened microbiologically approximately every 1–3 months and answer ongoing health, exposure, and dietary questionnaires. Results: In the first 2 years of our program, 5 of 322 (1.6%) prospective stool donors passed initial screening, and only 2 (0.6%) were retained. Most prospective donors were excluded on telephone screening, at which point high BMI, medication use, and family history of relevant illness were common exclusions. No candidate was excluded because of a concerning physical examination. Microbiologic reasons for donor exclusion included carriage of Blastocystis hominis ( n = 2), Helicobacter pylori ( n = 2), extended spectrum beta-lactamase producing organisms ( n = 1), Shiga-toxin producing Escherichia coli ( n = 1), and sapovirus ( n = 1). Universal donors were lost temporarily because of travel, antibiotic exposures, and transient carriage of antibiotic-resistant organisms. Conclusions: Recruiting and retaining suitable donors for FMT is challenging because of rigorous exclusions and labour-intensive screening processes. We present considerations for efficiency in donor screening, including targeting recruitment populations, expanded website self-screening, eliminating physical examinations, and streamlining post-travel risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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