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Enregistrement W2980145409 · doi:10.1038/s41598-019-50862-1

Characterisation of aptamer-anchored poly(EDMA-co-GMA) monolith for high throughput affinity binding

2019· article· en· W2980145409 sur OpenAlexaff
Caleb Acquah, Yi Wei Chan, Sharadwata Pan, Lau Sie Yon, Clarence M. Ongkudon, Michael K. Danquah

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCurtin University of Technology
Mots-clésAptamerChemistryMonolithEthylenediaminePolymerPolymer chemistryThermogravimetric analysisChemical engineeringOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Immobilisation of aptameric ligands on solid stationary supports for effective binding of target molecules requires understanding of the relationship between aptamer-polymer interactions and the conditions governing the mass transfer of the binding process. Herein, key process parameters affecting the molecular anchoring of a thrombin-binding aptamer (TBA) onto polymethacrylate monolith pore surface, and the binding characteristics of the resulting macroporous aptasensor were investigated. Molecular dynamics (MD) simulations of the TBA-thrombin binding indicated enhanced Guanine 4 (G4) structural stability of TBA upon interaction with thrombin in an ionic environment. Fourier-transform infrared spectroscopy and thermogravimetric analyses were used to characterise the available functional groups and thermo-molecular stability of the immobilised polymer generated with Schiff-base activation and immobilisation scheme. The initial degradation temperature of the polymethacrylate stationary support increased with each step of the Schiff-base process: poly(Ethylene glycol Dimethacrylate-co-Glycidyl methacrylate) or poly(EDMA-co-GMA) [196.0 °C (±1.8)]; poly(EDMA-co-GMA)-Ethylenediamine [235.9 °C (±6.1)]; poly(EDMA-co-GMA)-Ethylenediamine-Glutaraldehyde [255.4 °C (±2.7)]; and aptamer-modified monolith [273.7 °C (±2.5)]. These initial temperature increments reflected in the associated endothermic energies were determined with differential scanning calorimetry. The aptameric ligand density obtained after immobilisation was 480 pmol/μL. Increase in pH and ionic concentration affected the surface charge distribution and the binding characteristics of the aptamer-modified disk-monoliths, resulting in the optimum binding pH and ionic concentration of 8.0 and 5 mM Mg 2+ , respectively. These results are critical in understanding and setting parametric constraints indispensable to develop and enhance the performance of aptasensors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,513

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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