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Enregistrement W2980222461 · doi:10.1042/bio04102014

Measuring molecular interactions in solution using multi-wavelength analytical ultracentrifugation: combining spectral analysis with hydrodynamics

2019· article· en· W2980222461 sur OpenAlexaff
Borries Demeler

Notice bibliographique

RevueThe Biochemist · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein purification and stability
Établissements canadiensUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical Sciences
Mots-clésAnalytical UltracentrifugationUltracentrifugeNanotechnologyColloidWavelengthComputer scienceChemistryMaterials sciencePhysicsChromatographyOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In 1926, the Swedish scientist Theodor Svedberg was awarded the Nobel Prize in Chemistry for his work on a disperse system, and for studying the colloidal properties of proteins. This work was, to a large extent, made possible by his invention of a revolutionary tool, the analytical ultracentrifuge. These days, technological advances in hardware and computing have transformed the field of analytical ultracentrifugation (AUC) by enabling entirely new classes of experiments and modes of measurement unimaginable by Svedberg, making AUC once again an indispensable tool for modern biomedical research. In this article these advances and their impact on studies of interacting molecules will be discussed, with particular emphasis on a new method termed multi-wavelength analytical ultracentrifugation (MWL-AUC). Novel detectors allow us to add a second dimension to the separation of disperse and heterogeneous systems: in addition to the traditional hydrodynamic separation of colloidal mixtures, it is now possible to identify the sedimenting molecules by their spectral absorbance properties. The potential for this advance is significant for the study of a large range of systems. A further advance has occurred in data management and computational capabilities, opening doors to improved analysis methods, as well as direct networking with the instrument, facilitating data acquisition and data handling, and significant increases in data density from faster detectors with higher resolution capability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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