MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2980237789 · doi:10.1182/blood.v126.23.1638.1638

Fishing with a Transgenic Line: Using Zebrafish to Elucidate Mechanisms and Therapeutics in NUP98-NSD1 AML

2015· article· en· W2980237789 sur OpenAlexaff
Corey Filiaggi, Adam P Deveau, Sergey V. Prykhozhij, Graham Dellaire, Jason N. Berman

Notice bibliographique

RevueBlood · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishBiologyCancer researchMyeloproliferative neoplasmMyeloid leukemiaMyeloidGeneticsGeneImmunologyMyelofibrosisBone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The NUP98-NSD1 (NND1) translocation is a fusion oncogene recently identified in pediatric acute myeloid leukemia (AML), where it occurs in approximately 16% of patients. NND1 predicts a dismal prognosis, with a 4-year event-free survival <10%. The mechanism of action of NND1 may be through the activation of the posterior homeobox gene, HOXA9. NND1 patients often harbour an internal tandem duplication of fms-like tyrosine kinase 3 (FLT3-ITD), another genetic lesion associated with poor prognosis. Co-expression of NND1 and FLT3-ITD results in worse survival than either aberration in isolation. NND1 may be sufficient to produce a myeloproliferative phenotype, but the interaction with FLT3-ITD activates essential downstream signaling pathways necessary for AML pathogenesis. A better understanding of the mechanisms by which NND1 dysregulates hematopoiesis and interacts with FLT3-ITD is fundamental to developing targeted therapies to improve the outcome in this disease. The zebrafish has been established as a robust and reliable model of hematologic malignancies, with conserved genetics and ease of genetic interrogation. Our group previously generated a transgenic zebrafish model expressing the related fusion oncogene, NUP98-HOXA9, in which embryos had anemia and expansion of myeloid cells, and adult fish exhibited a myeloproliferative neoplasm (MPN). Using this model, we discovered novel downstream epigenetic regulators that could be targeted therapeutically and restore normal embryonic hematopoiesis. Moreover, the up-regulated genes that we identified correlated with features of high-risk AML in human datasets, highlighting the translational relevance of this human disease model and justifying the employment of this approach to investigate NND1-driven AML (Deveau et al, Leukemia 2015). Plasmid constructs have been generated that incorporate human NND1 into the zebrafish using the Tol2 system, with detection by green fluorescent protein (GFP) expression. Injection of CMV-NND1-sGFP revealed strong GFP expression from 24-48 hours post fertilization (hpf) ubiquitously and in hematopoietic cells. Whole-mount in situ hybridization experiments of plasmid-injected embryos have shown that, similar to the NUP98-HOXA9 model, embryos expressing NND1 develop a pre-leukemic state, with a decrease in red blood cell marker expression (gata1) and an increase in myeloid marker expression (l-plastin). Currently no animal models exist for NND1 AML. Our initial studies have revealed a myeloproliferative phenotype in zebrafish embryos, providing an in vivo tool for further genetic and epigenetic interrogation, as well as a preclinical platform for novel drug discovery in this disease. Disclosures No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,054
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood→Même sujetAcute Myeloid Leukemia Research→Travaux en français237 207→