Low phosphate represses histone deacetylase complex1 to regulate root system architecture remodeling in <i>Arabidopsis</i>
Notice bibliographique
Résumé
Summary The mechanisms involved in the regulation of gene expression in response to phosphate (Pi) deficiency have been extensively studied, but their chromatin‐level regulation remains poorly understood. We examined the role of histone acetylation in response to Pi deficiency by using the histone deacetylase complex1 ( hdc1 ) mutant. Genes involved in root system architecture (RSA) remodeling were analyzed by quantitative real‐time polymerase chain reaction (qPCR) and chromatin immunoprecipitation qPCR. We demonstrate that histone H3 acetylation increased under Pi deficiency, and the hdc1 mutant was hypersensitive to Pi deficiency, with primary root growth inhibition and increases in root hair number. Concomitantly, Pi deficiency repressed HDC1 protein abundances. Under Pi deficiency, hdc1 accumulated higher concentrations of Fe 3+ in the root tips and had higher expression of genes involved in RSA remodeling, such as ALUMINUM‐ACTIVATED MALATE TRANSPORTER1 ( ALMT1 ), LOW PHOSPHATE ROOT1 ( LPR1 ), and LPR2 compared with wild‐type plants. Furthermore, Pi deficiency enriched the histone H3 acetylation of ALMT1 and LPR1 . Finally, genetic evidence showed that LPR1/2 was epistatic to HDC1 in regulating RSA remodeling. Our results suggest a chromatin‐level control of Pi starvation responses in which HDC1‐mediated histone H3 deacetylation represses the transcriptional activation of genes involved in RSA remodeling in Arabidopsis .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».