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Enregistrement W2980410901 · doi:10.1089/neu.2019.6674

FAIR SCI Ahead: The Evolution of the Open Data Commons for Pre-Clinical Spinal Cord Injury Research

2019· review· en· W2980410901 sur OpenAlexaff
Karim Fouad, John L. Bixby, Alison Callahan, Jeffrey S. Grethe, Lyn B. Jakeman, Vance Lemmon, David S.K. Magnuson, Maryann E. Martone, Jessica L. Nielson, Jan M. Schwab, Carol Taylor‐Burds, Wolfram Tetzlaff, Abel Torres‐Espín, Adam R. Ferguson, Sabina Alam, Mark Bacon, Linda L. Bambrick, Michele Basso, Michael S. Beattie, Jacqueline C. Bresnahan, John C. Gensel, Dustin M. Graham, J. Russell Huie, Linda Jones, Patricia Kabitzke, Naomi Kleitman, Audrey Kusiak, Brian K. Kwon, Rosi Lederer, Verena May, Ellen P. Neff, Sasha Rabchevsky

Notice bibliographique

RevueJournal of Neurotrauma · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensInternational Collaboration On Repair DiscoveriesWomen and Children’s Health Research Institute
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésData sharingOpen dataSpinal cord injuryInteroperabilityBusinessMedicineComputer scienceWorld Wide Web

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Over the last 5 years, multiple stakeholders in the field of spinal cord injury (SCI) research have initiated efforts to promote publications standards and enable sharing of experimental data. In 2016, the National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke hosted representatives from the SCI community to streamline these efforts and discuss the future of data sharing in the field according to the FAIR (Findable, Accessible, Interoperable and Reusable) data stewardship principles. As a next step, a multi-stakeholder group hosted a 2017 symposium in Washington, DC entitled "FAIR SCI Ahead: the Evolution of the Open Data Commons for Spinal Cord Injury research." The goal of this meeting was to receive feedback from the community regarding infrastructure, policies, and organization of a community-governed Open Data Commons (ODC) for pre-clinical SCI research. Here, we summarize the policy outcomes of this meeting and report on progress implementing these policies in the form of a digital ecosystem: the Open Data Commons for Spinal Cord Injury (ODC-SCI.org). ODC-SCI enables data management, harmonization, and controlled sharing of data in a manner consistent with the well-established norms of scholarly publication. Specifically, ODC-SCI is organized around virtual "laboratories" with the ability to share data within each of three distinct data-sharing spaces: within the laboratory, across verified laboratories, or publicly under a creative commons license (CC-BY 4.0) with a digital object identifier that enables data citation. The ODC-SCI implements FAIR data sharing and enables pooled data-driven discovery while crediting the generators of valuable SCI data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,267
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,332
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,991
Score d'incertitude au seuil0,903

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2670,332
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0080,009
Études des sciences et des technologies0,0130,040
Communication savante0,0390,072
Science ouverte0,0090,053
Intégrité de la recherche0,0190,027
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0110,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,955
Tête enseignante GPT0,774
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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