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Enregistrement W2980459329 · doi:10.1371/journal.ppat.1008111

The herpes simplex virus host shutoff (vhs) RNase limits accumulation of double stranded RNA in infected cells: Evidence for accelerated decay of duplex RNA

2019· article· en· W2980459329 sur OpenAlexafffund
Bianca Dauber, Holly A. Saffran, James R. Smiley

Notice bibliographique

RevuePLoS Pathogens · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHerpesvirus Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésRNA silencingBiologyRNAProtein kinase RRNase PHerpes simplex virusMolecular biologyMessenger RNACell biologyVirologyVirusRNA interferenceProtein kinase AKinaseGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The herpes simplex virus virion host shutoff (vhs) RNase destabilizes cellular and viral mRNAs and blunts host innate antiviral responses. Previous work demonstrated that cells infected with vhs mutants display enhanced activation of the host double-stranded RNA (dsRNA)-activated protein kinase R (PKR), implying that vhs limits dsRNA accumulation in infected cells. Confirming this hypothesis, we show that partially complementary transcripts of the UL23/UL24 and UL30/31 regions of the viral genome increase in abundance when vhs is inactivated, giving rise to greatly increased levels of intracellular dsRNA formed by annealing of the overlapping portions of these RNAs. Thus, vhs limits accumulation of dsRNA at least in part by reducing the levels of complementary viral transcripts. We then asked if vhs also destabilizes dsRNA after its initial formation. Here, we used a reporter system employing two mCherry expression plasmids bearing complementary 3' UTRs to produce defined dsRNA species in uninfected cells. The dsRNAs are unstable, but are markedly stabilized by co-expressing the HSV dsRNA-binding protein US11. Strikingly, vhs delivered by super-infecting HSV virions accelerates the decay of these pre-formed dsRNAs in both the presence and absence of US11, a novel and unanticipated activity of vhs. Vhs binds the host RNA helicase eIF4A, and we find that vhs-induced dsRNA decay is attenuated by the eIF4A inhibitor hippuristanol, providing evidence that eIF4A participates in the process. Our results show that a herpesvirus host shutoff RNase destabilizes dsRNA in addition to targeting partially complementary viral mRNAs, raising the possibility that the mRNA destabilizing proteins of other viral pathogens dampen the host response to dsRNA through similar mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,656

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,179
Tête enseignante GPT0,384
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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