MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2980777844 · doi:10.1016/j.jalz.2019.06.661

P1‐106: A MULTIPLEX MASS SPECTROMETRY METHOD FOR CHARACTERIZATION AND QUANTIFICATION OF α‐ AND β‐SYNUCLEINS IN BRAIN TISSUE: APPLICATION TO TRANSGENIC MOUSE MODELS OF PARKINSON'S DISEASE

2019· article· en· W2980777844 sur OpenAlexaff
Serena Singh, Anouar Khayachi, Austen J. Milnerwood, Mari L. DeMarco

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParkinson's Disease Mechanisms and Treatments
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalProvidence Health CareMcGill UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMultiplexSynucleinChemistryGenetically modified mouseParkinson's diseaseSynucleinopathiesPathologyBiologyTransgeneBiochemistryAlpha-synucleinMedicineDiseaseBioinformaticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

α-Synuclein deposits are the primary neuropathological finding in dementia with Lewy bodies and are found as a co-pathology in approximately half of Alzheimer's disease cases. Animal models used to study synuclein pathology include those overexpressing α-synuclein and with mutations linked to familial Parkinson's disease (e.g. mutations in SNCA, LRRK2, etc.). Among these are models that display cognitive deficits, and also cortical α-synuclein aggregates as seen in dementia with Lewy bodies. Analysis of α-synuclein in brain tissue from both humans and mouse models by traditional antibody-based methods (e.g. immunoassay, western blot) has helped in the characterization of the models; however, antibody-based methods have their limitations including indirect analyte detection, lack of selectivity and challenges with multiplexing targets. As such, it would be advantageous to develop a new tool using mass spectrometry, which offers improved selectivity and multiplexing ability, for direct detection of synucleins and their modified forms in disease. A multiple reaction monitoring high-resolution liquid chromatography tandem mass spectrometry method was developed to quantify both soluble α- and β-synucleins in brain tissue homogenate. The method monitored six tryptic peptides from the α-synuclein sequence, which included three regions unique to α-synuclein and three regions shared between α- and β-synuclein. Synucleins were enriched from brain homogenate by heat treatment and quantification was achieved by addition of uniformly N-labeled human α-synuclein as an internal standard. The method was then applied to the characterization of brain tissue from wild-type and transgenic mouse models of synucleinopathies. With the multiplex mass spectrometry method, total α-synuclein and combined α- and β-synuclein were quantified in a single measurement. The tool also enabled differentiation of species-specific contributions to α-synclein burden in a transgenic model expressing both mouse and human synuclein. Finally, by monitoring multiple tryptic peptides from synuclein, peptide-specific profile differences were observed that may reflect post-translational modifications along the protein sequence. Mass spectrometry is a selective and cost-effective alternative to antibody-based methods for quantitation and characterization of synucleins. Ongoing applications of this tool include detailed characterization of α-synuclein pathology in experimental mouse models and human tissues.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & Dementia→Même sujetParkinson's Disease Mechanisms and Treatments→Travaux en français237 207→