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Enregistrement W2980870787 · doi:10.1186/s12862-019-1510-4

Geographic isolation and climatic variability contribute to genetic differentiation in fragmented populations of the long-lived subalpine conifer Pinus cembra L. in the western Alps

2019· article· en· W2980870787 sur OpenAlexafffund
Endre Gy. Tóth, Francine Tremblay, Johann Housset, Yves Bergeron, Christopher Carcaillet

Notice bibliographique

RevueBMC Evolutionary Biology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversité du Québec à MontréalUniversité du Québec en Abitibi-Témiscamingue
Organismes subventionnairesUniversité de MontpellierCentre National de la Recherche ScientifiqueAgence Nationale de la RechercheUniversité du Québec à MontréalEuropean CommissionBiodiversa+Université du Québec à Chicoutimi
Mots-clésBiologyMontane ecologyEcologyPinus <genus>Woody plantEntomologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Genetic processes shape the modern-day distribution of genetic variation within and between populations and can provide important insights into the underlying mechanisms of evolution. The resulting genetic variation is often unequally partitioned within species' distribution range and especially large differences can manifest at the range limit, where population fragmentation and isolation play a crucial role in species survival. Despite several molecular studies investigating the genetic diversity and differentiation of European Alpine mountain forests, the climatic and demographic constrains which influence the genetic processes are often unknown. Here, we apply non-coding microsatellite markers to evaluate the sporadic peripheral and continuous populations of cembra pine (Pinus cembra L.), a long-lived conifer species that inhabits the subalpine treeline ecotone in the western Alps to investigate how the genetic processes contribute to the modern-day spatial distribution. Moreover, we corroborate our findings with paleoecological records, micro and macro-remains, to infer the species' possible glacial refugia and expansion scenarios. RESULTS: based approaches, across the range of the species, situated in the northern, inner and south-western Alps. We found that genetic differentiation is substantially higher in marginal populations than at the center of the range, and marginal stands are characterized by geographic and genetic isolation due to spatial segregation and restricted gene flow. Moreover, multiple matrix regression approaches revealed effects of climatic heterogeneity in species' spatial genetic pattern. Also, population stability tests indicated that all populations had experienced a severe historical bottleneck, no heterozygosity excess was detected, suggesting that more recently population sizes have remained relatively stable. CONCLUSIONS: Our study demonstrated that cembra pine might have survived in multiple glacial refugia and subsequently recolonized the Alps by different routes. Modern-day marginal populations, at the edge of the species' range, could maintain stable sizes over long periods without inbreeding depression and preserve high amounts of genetic variation. Moreover, our analyses indicate that climatic variability has played a major role in shaping differentiation, in addition to past historical events such as migration and demographic changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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