Egg activation triggers clearance of maternally deposited RNA binding proteins
Notice bibliographique
Résumé
SUMMARY The maternal-to-zygotic transition (MZT) is a conserved step in animal development, where control is passed from the maternal genome to the zygotic one. Although the MZT is typically considered from its impact on the transcriptome, we previously found that three maternally deposited Drosophila RNA binding proteins (ME31B, Trailer Hitch [TRAL], and Cup) are also cleared during the MZT by unknown mechanisms. Here, we show that these proteins are degraded by the ubiquitin-proteasome system. Kondo, an E2 conjugating enzyme, and the E3 CTLH ligase are required for the destruction of ME31B, TRAL, and Cup. Importantly, despite occurring hours earlier, egg activation establishes the timer for clearance of these proteins by activating the Pan Gu kinase, which in turn stimulates translation of Kondo mRNA. In other words, egg activation triggers a series of regulatory events that culminate in the degradation of maternally deposited RNA binding proteins several hours later. Clearance of the maternal protein dowry thus appears to be a coordinated, but as-yet underappreciated, aspect of the MZT. HIGHLIGHTS Degradation of ME31B requires the PNG kinase, but not fertilization The ubiquitin-proteasome system degrades ME31B via CTLH E3 ligase and the UBC-E2H/Kondo ubiquitin-conjugating enzyme The association of ME31B with the CTLH complex does not require PNG activity PNG kinase mediates the translational upregulation of Kondo at egg activation
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».