Association between dectin-1 gene single nucleotide polymorphisms and fungal infection: a systemic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To investigate the association between dectin-1 gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) and susceptibility to fungal infection (FI). METHODS: Databases were searched electronically and manually to identify case-control studies concerning dectin-1 SNPs and FI, which were published up to 12 November 2018. The Newcastle-Ottawa Quality Assessment Scale was used to determine the study quality and bias. The SNP frequencies of the B (the variant or minor allele) and A (the wild or major allele) alleles of the dectin-1 gene in both cases and controls were analyzed with regard to FI susceptibility. RESULTS: Eight high-quality studies were included in the review. Systemic review of the included studies demonstrated that dectin-1 SNPs rs3901533 and rs7309123 might be associated with susceptibility to invasive pulmonary aspergillosis infection; moreover, rs16910527 SNP can possibly increase the susceptibility to oropharyngeal candidiasis in HIV-positive patients. The meta-analysis identified significant associations between dectin-1 SNPs and overall FI risk in the homozygote model (pooled odds ratio (OR) 1.77, P=0.04). When classified by subtypes, significant associations were also found for deep FI in the homozygote model (pooled OR 2.46, P=0.01) and the recessive model (pooled OR 2.85, P=0.002). There appeared to be no significant association between dectin-1 SNPs and superficial FI. CONCLUSION: Systemic review of the included studies suggested that dectin-1 SNPs rs3901533, rs7309123, and rs16910527 might play a role in FI susceptibility. The meta-analysis provided convincing evidence that dectin-1 SNPs might have an important role in FI susceptibility, especially for deep FI.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,013 | 0,019 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».