Pegasus, a small extracellular peptide regulating the short-range diffusion of Wingless
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Small Open Reading Frames (smORFs) coding for peptides of less than 100 amino-acids are emerging as a fundamental and pervasive gene class, found in the hundreds of thousands in metazoan genomes. Even though some of these genes are annotated, their function, if any, remains unknown. Here we characterize the function of a smORF encoding a short 80 aa peptide, pegasus ( peg ), which facilitates Wg diffusion during the development of the Drosophila wing imaginal disc. During wing development, Wg has sequential functions, and in the later stages, when peg is strongly expressed, it patterns the presumptive wing margin. A reduction in Wg protein secretion at this stage produces effects ranging from total abolition of the wing margin to partial loss of bristles and reduction of proneural gene expression. Here we show that the Peg peptide enhances the short-range of Wg diffusion in this context, in order to produce a proper wing margin. We show that CRISPR/Cas9-mediated mutations of pegasus generate wing margin phenotypes, and changes in target gene expression, consistent with a role in Wg signalling. We find that Peg is secreted, and that it co-localizes and co-immunoprecipitates with Wg, suggesting that Peg directly binds Wg in order to enhance its signalling, and our data from fixed and in-vivo Wg gradient measurements supports a model in which this enhancement occurs by increasing diffusion of extracellular Wg. Our results unveil a new element in the regulation of the Wg signalling pathway, and shed light on the functional consequences of the miss-regulation of Wg diffusion in this developmental context, while also reminding us of the functional diversity, and relevance of small open reading frame genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».