MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2980946885 · doi:10.1101/806778

Parallel Factor Analysis for multidimensional decomposition of fNIRS data

2019· preprint· en· W2980946885 sur OpenAlexafffund
Alejandra Hüsser, Laura Caron-Desrochers, Julie Tremblay, Phetsamone Vannasing, Eduardo Martínez‐Montes, Anne Gallagher

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOptical Imaging and Spectroscopy Techniques
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de MontréalCégep Marie-Victorin
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesHospital for Sick ChildrenNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésArtifact (error)Computer scienceFunctional near-infrared spectroscopyArtificial intelligenceIndependent component analysisPattern recognition (psychology)Principal component analysisMultidimensional analysisMathematicsStatisticsPsychology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Significance Current techniques for data analysis in functional near-infrared spectroscopy (fNIRS), such as artifact correction, do not allow to integrate the information originating from both wavelengths, considering only temporal and spatial dimensions of the signal’s structure. Parallel factor analysis (PARAFAC) has previously been validated as a multidimensional decomposition technique in other neuroimaging fields. Aim We aimed to introduce and validate the use of PARAFAC for the analysis of fNIRS data, which is inherently multidimensional (time, space, wavelength). Approach We used data acquired in 17 healthy adults during a verbal fluency task to compare the efficacy of PARAFAC for motion artifact correction to traditional 2D decomposition techniques, i.e. target principal (tPCA) and independent component analysis (ICA). Correction performance was further evaluated under controlled conditions with simulated artifacts and hemodynamic response functions. Results PARAFAC achieved significantly higher improvement in data quality as compared to tPCA and ICA. Correction in several simulated signals further validated its use and promoted it as a robust method independent of the artifact’s characteristics. Conclusions This study describes the first implementation of PARAFAC in fNIRS and provides validation for its use to correct artifacts. PARAFAC is a promising data-driven alternative for multidimensional data analyses in fNIRS and this study paves the way for further applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,023
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,033

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,023
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0100,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetOptical Imaging and Spectroscopy TechniquesTravaux en français237 207