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Enregistrement W2981026969 · doi:10.1161/res.125.suppl_1.602

Abstract 602: Mir-182-5p is a Conserved Downstream Effector of Tbx5 Involved in Heart Development and Arrhythmia in Zebrafish

2019· article· en· W2981026969 sur OpenAlexaff
Elena Guzzolino, Mario Pellegrino, Neha Ahuja, Deborah M. Garrity, Romina D’Aurizio, Marco Groth, Mario Baumgart, Cathy J. Hatcher, Alberto Mercatanti, Monica Evangelista, Chiara Ippolito, Elisabetta Tognoni, R. Fukuda, Vincenzo Lionetti, Letizia Pitto

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensHatch (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishDownregulation and upregulationBiologyCell biologyTranscription factorHeart developmentInternal medicineEndocrinologyMedicineEmbryonic stem cellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: TBX5 mutations cause Holt-Oram syndrome (HOS) characterized by upper limb and cardiac malformations, but can also contribute to early-onset of atrial fibrillation. Focusing on miRNAs involved in TBX5 regulatory circuits with a cardiac relevant role, we identified miR-182-5p, belonging to miR-183 cluster, found upregulated in Tbx5-depleted hearts of mouse and zebrafish embryos. Methods: To functionally analyse the miR-182-5p role in developing heart, miR-182-5p was dysregulated in zebrafish zygotes of Tg(Myl7:EGFP) and Tg(myl7:gCaMP) transgenic lines. To stably deregulate miR-182-5p in zebrafish heart we exploited the Gal4/UAS system to restrict the miR-182 expression into cardiac context. For physiological analyses we performed the mechanogram of cardiac contraction and electrocardiogram recording. To understand miR-182-5p downstream regulation, in silico analyses, followed by ddPCR/real-time quantifications on dissected zebrafish hearts and rescue experiments both in transient and stable miR-182-5p overexpressing zebrafish embryos were performed. Results: Depletion of Tbx5 from cardiomyocytes increased the expression of miR-182 cluster family that is controlled by Kruppel-like factor 4 (KLF4), a transcription factor repressed by Tbx5. Both transient and stable upregulation of miR-182 in zebrafish affect heart morphology, calcium handling and the onset of arrhythmia while its cardiac-specific downregulation decreases cardiac defects in zebrafish HOS hearts. Expression analyses on selected miR-182-5p putative targets revealed that several calcium channel proteins resulted downregulated in miR-182-5p overexpressing hearts. Transgenic zebrafish line stably overexpressing miR-182-5p in the heart manifested arrhythmia overtime with or without cardiac structural defects. Conclusion: We identified miR-182-5p as a potential suitable target to interfere in the circuit between upstream genetic abnormalities and downstream effectors leading to arrhythmia occurrence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,355
Score d'incertitude au seuil0,556

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,338
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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