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Enregistrement W2981288461 · doi:10.1186/s12879-019-4453-x

Pulmonary Cryptococcus infections as a manifestation of idiopathic CD4 lymphocytopenia: case report and literature review

2019· article· en· W2981288461 sur OpenAlexaff
Christina S. Thornton, Oscar Larios, Jennifer Grossman, Thomas P. Griener, Steven Vaughan

Notice bibliographique

RevueBMC Infectious Diseases · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCryptococcus neoformansCryptococcusLymphocytopeniaMedicineEtiologyMedical microbiologyPopulationRare diseaseCryptococcosisCryptococcus gattiiImmunologyDiseasePediatricsPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Idiopathic CD4 lymphocytopenia (ICL) is a rare clinical disease with relative CD4 deficiency in the absence of HIV infection. The pathogenicity of ICL is poorly understood with an unclear incidence rate in the general population. Sequelae of ICL includes AIDS-defining infections, which most commonly includes Cryptococcus neoformans. Typically, C. neoformans infections present with CNS involvement but rarely with extra-CNS manifestations. Here, we present a rare case of ICL with exclusively primary pulmonary cryptococcus and a review of the literature. Case presentation A 56-year-old female presented to our tertiary care hospital requiring a right hip open reduction intervention. The patient became febrile during admission, prompting a work-up that included a chest X-ray showing a peripheral pulmonary solitary nodule. Transthoracic biopsy revealed encapsulated yeast forms in keeping with C. neoformans. CD4 counts, repeated at least one month apart, were < 200 cells/mm3, with negative HIV testing. Flow cytometry and genetic testing were completed to elucidate the etiology of the immune deficiency, both of which were unremarkable. She was subsequently treated with 12 months of posaconazole with clinical resolution. Conclusions Our patient highlights a rare clinical disease, which a review of literature revealed only five cases in the literature with exclusive pulmonary Cryptococcus in ICL/ This case demonstrates the strong clinical acumen required to properly diagnose and ultimately manage the patient.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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